RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 MTMR11A4FU01 709 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 NEMP1O14524 444 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 USP12O75317 370 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ZFPL1O95159 310 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 OAZ2O95190 189 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 TUBB4AP04350 444 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 RAP2AP10114 183 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 GNA11P29992 359 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ECHS1P30084 290 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 NMT1P30419 496 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ACADVLP49748 655 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 RCAN1P53805 252 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CACNA2D1P54289 1103 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 C21orf59P57076 290 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 BNC1Q01954 994 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CAPSQ13938 189 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CYP2A13Q16696 494 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00303Q3SY05 128 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 EID2Q8N6I1 236 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 FANCBQ8NB91 859 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 STON2Q8WXE9 905 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 UBXN4Q92575 508 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 GJA10Q969M2 543 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 KLK15Q9H2R5 256 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 LDAHQ9H6V9 325 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM206Q9H813 350 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 BARHL2Q9NY43 387 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 PSMD10O75832 226 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 YEATS4O95619 227 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ADCY5O95622 1261 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 ACADMP11310 421 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CPA1P15085 419 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 HDCP19113 662 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 FPR1P21462 350 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 PDE6CP51160 858 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 MYBPC2Q14324 1141 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 KCNB1Q14721 858 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF77Q15935 545 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 FHL5Q5TD97 284 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ADALQ6DHV7 355 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 NECAB1Q8N987 351 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 FSIP1Q8NA03 581 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRK-211ENST00000429595 FAM20AQ96MK3 541 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 TIGD1Q96MW7 591 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 MYOCQ99972 504 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 PTPRDP23468 1912 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 FBN2P35556 2912 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 KNTC1P50748 2209 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 ARID2Q68CP9 1835 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-211ENST00000429595 A1L4Q6 167 aa6.49□□□□□ -1.37
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