RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD36A6QL64 1941 aa18.08■□□□□ 0.49
HERC3-205ENST00000426683 GOLGA8CPA6NN73 597 aa18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 PRLP01236 227 aa18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 ITGAVP06756 1048 aa18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 LHCGRP22888 699 aa18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 HNF1BP35680 557 aa18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 DENND2CQ68D51 928 aa18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 RHBDD1Q8TEB9 315 aa18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 SAP25Q8TEE9 199 aa18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 SMIM14Q96QK8 99 aa18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 FAM118BQ9BPY3 351 aa18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 C10orf88Q9H8K7 445 aa18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa18.08■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 A0A0J9YYE9 177 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 TRBC1P01850 177 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 PCCBP05166 539 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 GM2AP17900 193 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 RBL1P28749 1068 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 RPL26P61254 145 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 YPEL5P62699 121 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 BNIP3Q12983 259 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 ARHGEF7Q14155 803 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 FZD2Q14332 565 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 ZNF542PQ5EBM4 170 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 TPRG1LQ5T0D9 272 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 TSPAN33Q86UF1 283 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 COQ10AQ96MF6 247 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 ALS2CR12Q96Q35 445 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 VAT1Q99536 393 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 BTBD3Q9Y2F9 522 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 SPTBN4Q9H254 2564 aa18.07■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 TMEM131Q92545 1883 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 TOR1BO14657 336 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 SDC3O75056 442 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 CBFA2T3O75081 653 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 NFKB1P19838 968 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 CD68P34810 354 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 GRK6P43250 576 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 THOP1P52888 689 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 PTK2BQ14289 1009 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 INPP5AQ14642 412 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 PCSK7Q16549 785 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 INAVAQ3KP66 663 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
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HERC3-205ENST00000426683 PID1Q7Z2X4 250 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 PARGQ86W56 976 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 ZNF567Q8N184 647 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 PLA2G15Q8NCC3 412 aa18.06■□□□□ 0.48
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HERC3-205ENST00000426683 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 TADA1Q96BN2 335 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 FERMT1Q9BQL6 677 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 DNAJC28Q9NX36 388 aa18.06■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 A0A0U1RQS6 177 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 CAPN8A6NHC0 703 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 PSMD11O00231 422 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 RBP3P10745 1247 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 MTM1Q13496 603 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 GALNT3Q14435 633 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 RPS6KA1Q15418 735 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 SLC14A2Q15849 920 aa18.05■□□□□ 0.48
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HERC3-205ENST00000426683 SEL1L2Q5TEA6 688 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 MEI1Q5TIA1 1274 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 LRRC66Q68CR7 880 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 KDELC2Q7Z4H8 507 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 NUS1Q96E22 293 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 IFT43Q96FT9 208 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 ADGRE3Q9BY15 652 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 CAAP1Q9H8G2 361 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 UBP1Q9NZI7 540 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 TRHDEQ9UKU6 1024 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 DNPEPQ9ULA0 475 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 OR1A2Q9Y585 309 aa18.05■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD66B4E2M5 251 aa18.04■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 F5H423 210 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 PMPCBO75439 489 aa18.04■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 ETV3P41162 512 aa18.04■□□□□ 0.48
HERC3-205ENST00000426683 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
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