RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 FUT10Q6P4F1 479 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 GCNT7Q6ZNI0 430 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ITGA2P17301 1181 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 FEN1P39748 380 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ERLEC1Q96DZ1 483 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ASF1AQ9Y294 204 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 JAK1P23458 1154 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SMIM11AP58511 58 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SCIMPQ6UWF3 145 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 BNIPLQ7Z465 357 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 C19orf18Q8NEA5 215 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 OR4K2Q8NGD2 314 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ASZ1Q8WWH4 475 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TFAP2BQ92481 460 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SDCBP2Q9H190 292 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC17A7Q9P2U7 560 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ACSL4O60488 711 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ZMPSTE24O75844 475 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 MED26O95402 600 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 C22orf31O95567 290 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 PPIBP23284 216 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TTKP33981 857 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 OTOP3Q7RTS5 596 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 GATAD2AQ86YP4 633 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 STYXQ8WUJ0 223 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 COL26A1Q96A83 441 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 PCED1BQ96HM7 432 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CAB39LQ9H9S4 337 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 C2CD4BA6NLJ0 364 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 GCATO75600 419 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP6AP2O75787 350 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TGDSO95455 350 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 EOMESO95936 686 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 UMPSP11172 480 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 KELP23276 732 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CXCR3P49682 368 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ITGA1P56199 1179 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 MACC1Q6ZN28 852 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 OR8H2Q8N162 312 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 MAGEH1Q9H213 219 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 KCTD5Q9NXV2 234 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 DEC1Q9P2X7 70 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 C3orf18Q9UK00 162 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ARL5CA6NH57 179 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM25AB3EWG3 89 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM25CB3EWG5 89 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM25GB3EWG6 89 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 LRIG2O94898 1065 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CDH13P55290 713 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 HECTD2Q5U5R9 776 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 PLPP4Q5VZY2 271 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 KIAA0408Q6ZU52 694 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 RASAL3Q86YV0 1011 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 NPAS4Q8IUM7 802 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 RCN3Q96D15 328 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 MECRQ9BV79 373 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 EVA1BQ9NVM1 165 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 RAI2Q9Y5P3 530 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 EPORP19235 508 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 MAPKAPK2P49137 400 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ST13P50502 369 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 AP5B1Q2VPB7 878 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TAPT1Q6NXT6 567 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TRAF7Q6Q0C0 670 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CUZD1Q86UP6 607 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TCAIMQ8N3R3 496 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF384Q8TF68 577 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 VPS4AQ9UN37 437 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A1B0GVM2 712 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TCAF2A6NFQ2 919 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 PEX10O60683 326 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 DAOAP59103 153 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CDC42P60953 191 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 PEX6Q13608 980 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms