RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 DAB2P98082 770 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 PPARDQ03181 441 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ACOX1Q15067 660 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 LMX1AQ8TE12 382 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 COQ10AQ96MF6 247 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 LGMNQ99538 433 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 OR1A2Q9Y585 309 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 LRP4O75096 1905 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM149AA5PLN7 773 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 PSTPIP1O43586 416 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 GCATO75600 419 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 HLA-DQB2P05538 268 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TNNT1P13805 278 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM23P36406 574 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 DSC2Q02487 901 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CAMK2BQ13554 666 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ODF2Q5BJF6 829 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 FAXCQ5TGI0 409 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ENPP7Q6UWV6 458 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 IL12RB2Q99665 862 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC61Q9BV99 259 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 USP29Q9HBJ7 922 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TFR2Q9UP52 801 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 U3KQA8 63 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ASXL3Q9C0F0 2248 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 MYLKQ15746 1914 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 LMO7DNF2Z398 122 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNK1O00180 336 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 PSMD11O00231 422 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 NDUFA10O95299 355 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 LHCGRP22888 699 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 HK3P52790 923 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 E2F1Q01094 437 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TAZQ16635 292 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ALG11Q2TAA5 492 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 USP45Q70EL2 814 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ATL2Q8NHH9 583 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR92Q96MX6 357 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 OLFM3Q96PB7 478 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CLPBQ9H078 707 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 JCHAINP01591 159 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT10P13645 584 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 JUPP14923 745 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TSHRP16473 764 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 HNF1BP35680 557 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CDKN2BP42772 138 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA1024LP59773 190 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 C1orf61Q13536 156 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGEF7Q14155 803 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 PDK1Q15118 436 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPRRQ15256 657 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 PNCKQ6P2M8 343 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 RFX6Q8HWS3 928 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 HID1Q8IV36 788 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 NUS1Q96E22 293 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 DTD2Q96FN9 168 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ACACAQ13085 2346 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A0J9YYE9 177 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 RASGRP1O95267 797 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 PRLP01236 227 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 TRBC1P01850 177 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 ALPIP09923 528 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 MYF5P13349 255 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2E3-201ENST00000392415 CTPS1P17812 591 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms