RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A0G2JLW4 131 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 HMGCRP04035 888 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 BMP6P22004 513 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 RFX3P48380 749 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 SPERTQ8NA61 448 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 CHST13Q8NET6 341 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM143Q96AN5 459 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF347Q96SE7 839 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 PTPRHQ9HD43 1115 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 AP4E1Q9UPM8 1137 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC2A4P14672 509 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 EPB42P16452 691 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 YAP1P46937 504 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 NADK2Q4G0N4 442 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 RFWD3Q6PCD5 774 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 CPNE9Q8IYJ1 553 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 GMCL1Q96IK5 515 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 MBOAT7Q96N66 472 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM109Q9BVC6 243 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A096LPK6 155 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 AKAP3O75969 853 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ITGA3P26006 1051 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC6A4P31645 630 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 PRKCIP41743 596 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF543Q08ER8 600 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR162Q16538 588 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 MFSD7Q6UXD7 560 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 DSG4Q86SJ6 1040 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 NR2E1Q9Y466 385 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 PPEF2O14830 753 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 IFI30P13284 250 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 BIKQ13323 160 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 GRM3Q14832 879 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 CBWD2Q8IUF1 395 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 MMP19Q99542 508 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF146Q9NTX7 359 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP2-201ENST00000356331 MYOM1P52179 1685 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 H3BNH8 94 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CCNDBP1O95273 360 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 NUMBP49757 651 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TMBIM6P55061 237 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM32Q13049 653 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 IL18Q14116 193 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 LLGL2Q6P1M3 1020 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 COMMD2Q86X83 199 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 COPZ2Q9P299 210 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR27A2RRH5 827 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 BCKDKO14874 412 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PLIN3O60664 434 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PGRP06401 933 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MSR1P21757 451 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP3A7P24462 503 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ALDH9A1P49189 494 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CPT1AP50416 773 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 RORCP51449 518 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TAF13Q15543 124 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 GPSM1Q86YR5 675 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 LPCAT1Q8NF37 534 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC47A1Q96FL8 570 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MED8Q96G25 268 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTR6Q9GZN1 396 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 XPR1Q9UBH6 696 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SALL3Q9BXA9 1300 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR1P46091 355 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ADNP2Q6IQ32 1131 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ARMC8Q8IUR7 673 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC9A6Q92581 669 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 SIPA1Q96FS4 1042 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 POMKQ9H5K3 350 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CATSPERZQ9NTU4 200 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 USP20Q9Y2K6 914 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 LINGO3P0C6S8 592 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CHRNA5P30532 468 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAM1Q15629 374 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 CARTPTQ16568 116 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 DPY19L1Q2PZI1 675 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-201ENST00000356331 ACSBG2Q5FVE4 666 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms