RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353468.4

SIGMAR1-202, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SIGMAR1, Length 1,582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-202ENST00000353468 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.17■□□□□ 0.82
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SIGMAR1-202ENST00000353468 CYS1Q717R9 158 aa20.17■□□□□ 0.82
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SIGMAR1-202ENST00000353468 OR2W6PQ8NHA6 318 aa20.17■□□□□ 0.82
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SIGMAR1-202ENST00000353468 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SIGMAR1-202ENST00000353468 IL17CQ9P0M4 197 aa20.13■□□□□ 0.81
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SIGMAR1-202ENST00000353468 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa20.12■□□□□ 0.81
SIGMAR1-202ENST00000353468 FAM159BA6NKW6 160 aa20.12■□□□□ 0.81
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