RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.29□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 ARL5CA6NH57 179 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 PLK4O00444 970 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 DLL1O00548 723 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 ATE1O95260 518 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 IFNA16P05015 189 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 HSMCR30P0CW71 290 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 IL9P15248 144 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 LTBRP36941 435 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 SLC11A1P49279 550 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 RAC1P63000 192 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 STX3Q13277 289 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 PLD1Q13393 1074 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 SPARCL1Q14515 664 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 SSPNQ14714 243 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 INAVAQ3KP66 663 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 RTP2Q5QGT7 225 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 CACHD1Q5VU97 1274 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 NT5DC3Q86UY8 548 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 CPNE9Q8IYJ1 553 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 CADM2Q8N3J6 435 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 PIK3R3Q92569 461 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 NCLNQ969V3 563 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 CLDND1Q9NY35 253 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 EHD3Q9NZN3 535 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 CITO14578 2027 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 MICAL2O94851 1124 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 SLITRK5O94991 958 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 SNAP29O95721 258 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 GLP2RO95838 553 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 PRKCBP05771 671 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 CPB1P15086 417 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 ERFP50548 548 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 CDK16Q00536 496 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 IL9RQ01113 521 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 CTBSQ01459 385 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 TRIP10Q15642 601 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 EXOC3L4Q17RC7 722 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 UGT3A1Q6NUS8 523 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 GPBP1Q86WP2 473 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 GPR65Q8IYL9 337 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 ABI1Q8IZP0 508 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 CCDC120Q96HB5 630 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 DOK1Q99704 481 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 LHX5Q9H2C1 402 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 KLQ9UEF7 1012 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 NAGPAQ9UK23 515 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 AMFRQ9UKV5 643 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.28□□□□□ -1.24
CCR6-202ENST00000349984 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 FAM187AA6NFU0 413 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 MEI4A8MW99 385 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 I3L4J1 428 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 TM7SF2O76062 418 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 ASS1P00966 412 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 STAG3L1P0CL83 205 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 NMT1P30419 496 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 HPCAL1P37235 193 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 BNIP3Q12983 259 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 SELPLGQ14242 412 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 GALNT3Q14435 633 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 PGS1Q32NB8 556 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 ESCO2Q56NI9 601 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 DSG4Q86SJ6 1040 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 RNF135Q8IUD6 432 aa7.27□□□□□ -1.25
CCR6-202ENST00000349984 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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