RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ARSAP15289 507 aa20.81■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 DPP6P42658 865 aa20.81■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 SUOXP51687 545 aa20.81■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 INHBCP55103 352 aa20.81■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 PIGGQ5H8A4 983 aa20.81■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.81■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 CEP70Q8NHQ1 597 aa20.81■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.81■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 FAR2Q96K12 515 aa20.81■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ALG9Q9H6U8 611 aa20.81■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 SCN5AQ14524 2016 aa20.81■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 H7C4K7 107 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ADAM12O43184 909 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ACSL4O60488 711 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 THOP1P52888 689 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 C1QTNF8P60827 252 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 NFKB2Q00653 900 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 OR7D4Q8NG98 312 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 PHF21BQ96EK2 531 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 L3HYPDHQ96EM0 354 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 INHAP05111 366 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 RAG1P15918 1043 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM219BQ5XKK7 198 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 HIPK4Q8NE63 616 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 GATA6Q92908 595 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 DPPA5A6NC42 116 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 PENKP01210 267 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 LINGO3P0C6S8 592 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 PIRTP0C851 137 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 RGRP47804 291 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 GNA12Q03113 381 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 CYHR1Q6ZMK1 362 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 TTPALQ9BTX7 342 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 MAGEH1Q9H213 219 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 PHF24Q9UPV7 400 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 FIS1Q9Y3D6 152 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 NDST3O95803 873 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 GLP2RO95838 553 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 SERPINF2P08697 491 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 CD1DP15813 335 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 IMPDH1P20839 514 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 NOGQ13253 232 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 LAMB3Q13751 1172 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 GSTA3Q16772 222 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF678Q5SXM1 525 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM154Q6P9G4 183 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 RAET1EQ8TD07 263 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 SERPINI1Q99574 410 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 GJB5O95377 273 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 CEACAM7Q14002 265 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 PDSS2Q86YH6 399 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 CDRT15Q96T59 188 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 TRMOQ9BU70 441 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 EFEMP2O95967 443 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC4A1P02730 911 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 PEX2P28328 305 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 HOXD10P28358 340 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 STC1P52823 247 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 CDH4P55283 916 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 UNC50Q53HI1 259 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 MRNIPQ6NTE8 343 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 GK5Q6ZS86 529 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 PSKH2Q96QS6 385 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR41Q9HAD4 459 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNQ1-202ENST00000335475 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.9 ms