RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 GTSE1Q9NYZ3 720 aa18.77■□□□□ 0.6
PDLIM4-201ENST00000253754 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PDLIM4-201ENST00000253754 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PDLIM4-201ENST00000253754 A8MT66 165 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 AIM2O14862 343 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC7A4O43246 635 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 BAG2O95816 211 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 PDHA1P08559 390 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 MAPKAPK2P49137 400 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SEMA3AQ14563 771 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 GPR158Q5T848 1215 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 MTRRQ9UBK8 725 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 VWA7Q9Y334 891 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 GOT2P00505 430 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 RGRP47804 291 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 KCNC1P48547 511 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SGSHP51688 502 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 PFKPQ01813 784 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 BTKQ06187 659 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SMARCB1Q12824 385 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 CCNIQ14094 377 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC8B1Q6J4K2 584 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 ACAD11Q709F0 780 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC39A11Q8N1S5 342 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SMIM14Q96QK8 99 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SPON2Q9BUD6 331 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 NACA2Q9H009 215 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa18.76■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 NPHS1O60500 1241 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 BAIAP3O94812 1187 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SOD2P04179 222 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 ACADSP16219 412 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SYN1P17600 705 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 PRDX6P30041 224 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 NUDT2P50583 147 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 AGAP9Q5VTM2 703 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 IL31Q6EBC2 164 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 DENND1CQ8IV53 801 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 UBXN10Q96LJ8 280 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 RTKNQ9BST9 563 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF385DQ9H6B1 395 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 ALG9Q9H6U8 611 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 GREB1Q4ZG55 1949 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC162PA2VCL2 907 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 ACSL4O60488 711 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SULT2A1Q06520 285 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 ASPHQ12797 758 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 ANO7Q6IWH7 933 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF549Q6P9A3 640 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 BADQ92934 168 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 CNDP1Q96KN2 507 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 CLSTN3Q9BQT9 956 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 VTI1BQ9UEU0 232 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 DNMT3LQ9UJW3 386 aa18.75■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 PTPRSQ13332 1948 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 LAG3P18627 525 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 TSPAN8P19075 237 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 DNAJB13P59910 316 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 AP2B1P63010 937 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 GNA12Q03113 381 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 GKN1Q9NS71 199 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SPG21Q9NZD8 308 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 POMPQ9Y244 141 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 BACE2Q9Y5Z0 518 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SZT2Q5T011 3432 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 H3BNC9 293 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 IPO13O94829 963 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC14A2Q15849 920 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 FBXW8Q8N3Y1 598 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC26A7Q8TE54 656 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 TSPAN17Q96FV3 270 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 FEM1CQ96JP0 617 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 TTLL2Q9BWV7 592 aa18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC85CA6NKD9 419 aa18.73■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SLCO1B7G3V0H7 640 aa18.73■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SDHDO14521 159 aa18.73■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PDLIM4-201ENST00000253754 COCHO43405 550 aa18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms