RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cldn11Q60771 207 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Stmnd1Q6P3A1 279 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fstl5Q8BFR2 847 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Itpk1Q8BYN3 419 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Smoc2Q8CD91 447 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc35b2Q91ZN5 431 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gemin2Q9CQQ4 269 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppp1r2Q9DCL8 206 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cdh17Q9R100 827 aa22.65■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Galnt1O08912 559 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MrasO08989 208 aa22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ckmt1P30275 418 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Serpinb5P70124 375 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 NogP97466 232 aa22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Echdc2Q3TLP5 296 aa22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam131bQ3TY60 332 aa22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam160a1Q505K2 1081 aa22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MyorgQ69ZQ1 716 aa22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Akap7Q7TN79 314 aa22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hmgcll1Q8JZS7 343 aa22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc30a5Q8R4H9 761 aa22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mrpl17Q9D8P4 176 aa22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Asap1Q9QWY8 1147 aa22.64■■□□□ 1.22
Ubp1-204ENSMUST00000214095 1700001O22RikA2APZ1 375 aa22.64■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zscan4bE9Q3G0 505 aa22.64■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atn1O35126 1175 aa22.64■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppp3cbP48453 525 aa22.64■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tas2r16P59529 299 aa22.64■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Col28a1Q2UY11 1141 aa22.64■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Smndc1Q8BGT7 238 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pnpla8Q8K1N1 776 aa22.64■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fuca2Q99KR8 461 aa22.64■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CrotQ9DC50 612 aa22.64■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Aldoart1A6ZI46 419 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc4a9E9PUP3 929 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 1700024B05RikE9Q6D7 167 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn2r46L7N282 809 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ndst2P52850 883 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 YwhahP68510 246 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cspg5Q71M36 566 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wdr91Q7TMQ7 748 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc116Q80X53 541 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 ChfrQ810L3 664 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tgm6Q8BM11 706 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp45Q8K387 813 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tnip2Q99JG7 430 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cnot11Q9CWN7 505 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MecrQ9DCS3 373 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trhr2Q9ERT2 382 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nrf1Q9WU00 503 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gria3Q9Z2W9 888 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 9330159F19RikD3Z623 648 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm20828J3KMI7 228 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppef1O35655 650 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Per3O70361 1113 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CtsdP18242 410 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cd9P40240 226 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Il12bP43432 335 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lhx3P50481 400 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ext2P70428 718 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rsrp1Q3UC65 298 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rbm44Q3V089 1013 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp90Q61967 636 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp8Q80U87 1080 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem121Q80XA0 318 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Samd4aQ8CBY1 711 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr695Q8VFM3 315 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyp2c50Q91X77 490 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cdyl2Q9D5D8 503 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam83dQ9D7I8 585 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Isca2Q9DCB8 154 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 RecqlQ9Z129 648 aa22.63■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Srp72F8VQC1 671 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm43302L7N1X8 611 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tpst2O88856 376 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gbp10Q000W5 611 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 HdxQ14B70 692 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zyg11bQ3UFS0 744 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mocs1Q5RKZ7 636 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Actr5Q80US4 605 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 SvopQ8BFT9 548 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam78aQ8C552 283 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 4932414N04RikQ8CEQ9 752 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 BfarQ8R079 450 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cys1Q8R4T1 145 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1494Q8VGP8 315 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pcdhga10Q91XY9 930 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kif12Q9D2Z8 642 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Plagl1Q9JLQ4 704 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyhr1Q9QXA1 311 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Keap1Q9Z2X8 624 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gdf5P43027 495 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Uimc1Q5U5Q9 727 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1037Q7TR84 321 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TpbglQ8C013 384 aa22.62■■□□□ 1.21
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Grsf1Q8C5Q4 479 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.3 ms