RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Far1Q922J9 515 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Chit1Q9D7Q1 464 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc29a1Q9JIM1 460 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Akr1c12Q9JLI0 323 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Piwil1Q9JMB7 862 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fzd9Q9R216 592 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm28363A0A087WQW2 129 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Speer4cG3UXD1 256 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm10354K7N6A0 256 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cyp27b1O35084 507 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PolP11369 1281 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ass1P16460 412 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rnf215Q5SPX3 379 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr1252Q7TQZ2 314 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Samd4bQ80XS6 687 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Amigo1Q80ZD8 492 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ints6lQ8BND4 861 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adprhl2Q8CG72 370 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Serpina3nQ91WP6 418 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc12a9Q99MR3 914 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cab39lQ9DB16 337 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ndst3Q9EQH7 873 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 B4galt5Q9JMK0 388 aa17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CitP49025 2055 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Brca1P48754 1812 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rap1gapA2ALS5 663 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mtx3D3YTP3 312 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 LgmnO89017 435 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp868Q3UTQ6 422 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cfhr2Q4LDF6 332 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Arcn1Q5XJY5 511 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Galnt2Q6PB93 570 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tgm4Q8BZH1 670 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mcoln3Q8R4F0 553 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Akr1d1Q8VCX1 325 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mrpl57Q9CQF8 102 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Med10Q9CXU0 135 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q9D5Y0 588 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rdh11Q9QYF1 316 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp788E9Q980 884 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hoxb8P09632 243 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gon7P0C8B4 98 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gjb1P28230 283 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pla2g5P97391 137 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cry1P97784 606 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Q3UK37 420 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Foxn1Q61575 648 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 DgkqQ6P5E8 934 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tdp1Q8BJ37 609 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pggt1bQ8BUY9 377 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 MafaQ8CF90 359 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Syne4Q8CII8 388 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ebf4Q8K4J2 599 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trim31Q8R0K2 507 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Alas1Q8VC19 642 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Zfp566Q8VCI1 386 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Depdc7Q91WS7 511 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Slc35a5Q921R7 437 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lrrc71Q9D3W5 558 aa17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dthd1E9PZX1 795 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pik3cdO35904 1043 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cyp2c65Q148B1 490 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Treml2Q2LA85 329 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm3414Q3TNU4 584 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Shcbp1lQ3TTP0 639 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rnf145Q5SWK7 663 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Map1sQ8C052 973 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ttc34Q8C0Q3 554 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mamdc2Q8CG85 686 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 LipmQ8K2A6 422 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Wdr98Q8VC42 657 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ddx59Q9DBN9 619 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Abhd1Q9QZC8 412 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AadatQ9WVM8 425 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 0610012G03RikA0A0J9YTR2 95 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm12394A2AKP6 982 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pgbd1E9Q492 415 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AlpiF8VPQ6 554 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CstaP56567 97 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Stx1bP61264 288 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gng2P63213 71 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Eml1Q05BC3 814 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tigd2Q0VBL1 525 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Rnf157Q3TEL6 685 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Adamts18Q4VC17 1219 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Bcap31Q61335 245 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Olfr845Q7TRG2 312 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Kirrel1Q80W68 789 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tmtc4Q8BG19 741 aa17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Parp12Q8BZ20 711 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cfap61Q8CEL2 1252 aa17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.9 ms