RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019722.11

Ubxn6-201, Transcript of UBX domain-containing protein 6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn6, Length 2,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mup5P11591 180 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Agtr2P35374 363 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gli1P47806 1111 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 LeprP48356 1162 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 AnpepP97449 966 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Q5XFZ0 217 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Msi1Q61474 362 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gstt1Q64471 240 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Samd4bQ80XS6 687 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cnpy4Q8BQ47 245 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Acsm2Q8K0L3 575 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Vmn1r205Q8R276 316 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 ClmpQ8R373 373 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Pcdhgc3Q91XX1 934 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Pcdha11Q91Y19 950 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 DdoQ922Z0 341 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Itfg1Q99KW9 610 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cnot11Q9CWN7 505 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 PudpQ9D5U5 234 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Timp4Q9JHB3 224 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 AadatQ9WVM8 425 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Slfn2Q9Z0I6 378 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm3259D3YUK0 475 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm6614M0QWR8 670 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Il4i1O09046 630 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 C1qbP14106 253 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Asprv1Q09PK2 339 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mgat3Q10470 538 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Dnajb14Q149L6 379 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 CamkvQ3UHL1 512 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Fam83fQ3UKU4 495 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Pnma8aQ80VM8 430 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Sec22cQ8BXT9 303 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Stk-ps2Q8C0V7 499 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 NcaphQ8C156 731 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Oit3Q8R4V5 546 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Glis2Q8VDL9 521 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zfp617Q91WM0 559 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Prmt7Q922X9 692 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Sytl2Q99N50 950 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lrrc4Q99PH1 652 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 CtsrQ9JIA9 334 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Smad9Q9JIW5 430 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Fbxo16Q9QZM9 334 aa11.15□□□□□ -0.62
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm36028A0A0U1RPM1 299 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rrn3B2RS91 656 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm8113E0CXS8 587 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zfp558E9Q1J0 407 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Akain1G3UWD5 69 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm3739L7N296 216 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tpst2O88856 376 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 SagP20443 403 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 EsrrgP62509 458 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 PrkcgP63318 697 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Nfe2Q07279 373 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cpne9Q1RLL3 553 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Sec31bQ3TZ89 1158 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Akr1clQ3UXL1 322 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Btg1-ps1Q3V0S2 161 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Btg1-ps2Q3V0X0 161 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Serpina3gQ5I2A0 440 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ei24Q61070 340 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ecm1Q61508 559 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ifi47Q61635 420 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ces2bQ6PDB7 556 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Olfr1415Q7TQS4 311 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Clec2eQ80XD9 204 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rbm22Q8BHS3 420 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mtg1Q8R2R6 326 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Nol6Q8R5K4 1152 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Olfr1416Q8VGU4 312 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 PigxQ99LV7 254 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Retreg3Q9CQV4 466 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Idh3aQ9D6R2 366 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Olfr711Q9EPG2 314 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 CpqQ9WVJ3 470 aa11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Bag6Q9Z1R2 1154 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ttll8A4Q9F1 832 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm10479K7N6H4 105 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cyp2b19O55071 492 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tap2P36371 702 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Hrh2P97292 397 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Aqp1Q02013 269 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 ItkQ03526 625 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Znf235Q61116 645 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Q6GQU0 248 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 ChpfQ6IQX7 774 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Reps2Q80XA6 521 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gjd4Q8BSD4 364 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Slc35e2Q8C811 405 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gbp5Q8CFB4 590 aa11.14□□□□□ -0.63
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tmem221Q8K071 230 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26 ms