RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641340.1

MFSD8-223, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 2,098 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-223	ENST00000641340	SNHG28	P0DPA3	235 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	RFC2	P35250	354 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	SLC15A1	P46059	708 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	KCNJ1	P48048	391 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	MFAP3	P55082	362 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	GCNT1	Q02742	428 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	CLCA4	Q14CN2	919 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	NOMO1	Q15155	1222 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	CEBPE	Q15744	281 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	GPR162	Q16538	588 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	COMTD1	Q86VU5	262 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM129C	Q86XR2	697 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	DDI1	Q8WTU0	396 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	WNT8B	Q93098	351 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	USP28	Q96RU2	1077 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	JAM3	Q9BX67	310 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	NCDN	Q9UBB6	729 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	SNX6	Q9UNH7	406 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340		A0A1W2PRG0	241 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM86B1	E9PN63	330 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	PEX12	O00623	359 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	TSPAN4	O14817	238 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	RASGRF2	O14827	1237 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	TSPAN1	O60635	241 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	NIPSNAP2	O75323	286 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	LIPF	P07098	398 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	CTSB	P07858	339 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	CELA3B	P08861	270 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	UROS	P10746	265 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	SYN1	P17600	705 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	EPOR	P19235	508 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	CAPZA1	P52907	286 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	NPEPPS	P55786	919 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	KIAA1024L	P59773	190 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	GALNTL6	Q49A17	601 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	DLK2	Q6UY11	383 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	AMZ2	Q86W34	360 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	OR56A3	Q8NH54	315 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	CDKL2	Q92772	493 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	ELP4	Q96EB1	424 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	MGME1	Q9BQP7	344 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	NELFA	Q9H3P2	528 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	SCOC	Q9UIL1	159 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	SPACA6	W5XKT8	324 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF536	O15090	1300 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	MAGEB16	A2A368	324 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	KLRF2	D3W0D1	207 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	MAN2B1	O00754	1011 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	MED7	O43513	233 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	EXTL3	O43909	919 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	APOL3	O95236	402 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	VNN2	O95498	520 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	RALA	P11233	206 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	PTPN4	P29074	926 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	ARHGDIB	P52566	201 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	RTP1	P59025	263 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	TNFRSF17	Q02223	184 aa		7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
MFSD8-223	ENST00000641340	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28

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