RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637053.1

VIM-210, Transcript of vimentin, humanhuman

TSL 2

Gene VIM, Length 508 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-210ENST00000637053 MAGEA1P43355 309 aa3.05□□□□□ -1.92
VIM-210ENST00000637053 CDKN1BP46527 198 aa3.05□□□□□ -1.92
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VIM-210ENST00000637053 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
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VIM-210ENST00000637053 SLC5A3P53794 718 aa3.05□□□□□ -1.92
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VIM-210ENST00000637053 ATP12AP54707 1039 aa3.05□□□□□ -1.92
VIM-210ENST00000637053 KIAA1024LP59773 190 aa3.05□□□□□ -1.92
VIM-210ENST00000637053 KRTAP10-9P60411 292 aa3.05□□□□□ -1.92
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VIM-210ENST00000637053 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.05□□□□□ -1.92
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VIM-210ENST00000637053 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa3.05□□□□□ -1.92
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VIM-210ENST00000637053 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3.05□□□□□ -1.92
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VIM-210ENST00000637053 ZMAT4Q9H898 229 aa3.05□□□□□ -1.92
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VIM-210ENST00000637053 LZTFL1Q9NQ48 299 aa3.05□□□□□ -1.92
VIM-210ENST00000637053 SERHLQ9NQF3 203 aa3.05□□□□□ -1.92
VIM-210ENST00000637053 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
VIM-210ENST00000637053 C8orf4Q9NR00 106 aa3.05□□□□□ -1.92
VIM-210ENST00000637053 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
VIM-210ENST00000637053 GIMAP4Q9NUV9 329 aa3.05□□□□□ -1.92
VIM-210ENST00000637053 RGL1Q9NZL6 768 aa3.05□□□□□ -1.92
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