RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 SLC39A8Q9C0K1 460 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 EBF2Q9HAK2 575 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 LZTFL1Q9NQ48 299 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 VPS51Q9UID3 782 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 AK5Q9Y6K8 562 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PTPRBP23467 1997 aa5.96□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 TRABD2BA6NFA1 517 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 J3KR12 359 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CBX4O00257 560 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 TAF4O00268 1085 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 WNT9AO14904 365 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 MCF2LO15068 1137 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ALOX15BO15296 676 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SLC7A4O43246 635 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PRPSAP2O60256 369 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SDC3O75056 442 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 RFPL3O75679 317 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PRNPP04156 253 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 KRT1P04264 644 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 THBS1P07996 1170 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CCDC175P0C221 793 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 FAM157BP0CG42 384 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PYGMP11217 842 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 TNNT1P13805 278 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PRLRP16471 622 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CTNNA2P26232 953 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 EPHB2P29323 1055 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 AKT2P31751 481 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CHRNA3P32297 505 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 DRD3P35462 400 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 NUDT1P36639 197 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CDH6P55285 790 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 NXPH1P58417 271 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 TPI1P60174 286 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 DAB2P98082 770 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 GNA12Q03113 381 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 DNAH14Q0VDD8 3507 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 BNIP3Q12983 259 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 DNAJC3Q13217 504 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ACAP1Q15027 740 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ARL13BQ3SXY8 428 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SLC9A4Q6AI14 798 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 LINGO4Q6UY18 593 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 DBX2Q6ZNG2 339 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 BTLAQ7Z6A9 289 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 DAAM2Q86T65 1068 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 TMPRSS12Q86WS5 348 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF354CQ86Y25 554 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 KATNAL2Q8IYT4 538 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SLC35F6Q8N357 371 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PGBD5Q8N414 524 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 KIAA1524Q8TCG1 905 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PPP1R16AQ96I34 528 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 WDR24Q96S15 920 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 FAM118BQ9BPY3 351 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CALN1Q9BXU9 219 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 TNKS2Q9H2K2 1166 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 C10orf88Q9H8K7 445 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 LHX3Q9UBR4 397 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SARDHQ9UL12 918 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 GUCA1BQ9UMX6 200 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 DMTF1Q9Y222 760 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 RAXQ9Y2V3 346 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.95□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 A0A1W2PQU0 124 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 A0A1W2PR77 199 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ILVBLA1L0T0 632 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 LRRD1A4D1F6 860 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 C10orf142B7Z368 130 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 RASA4BC9J798 803 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 NEMP1O14524 444 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 FFAR2O15552 330 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 RASA4O43374 803 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PSTPIP1O43586 416 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 RNF8O76064 485 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CTSLP07711 333 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 THEGLP0DJG4 465 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CDK4P11802 303 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms