RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583841.1

TSPOAP1-AS1-210, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1-AS1, Length 840 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FAM47DPA6NHR8 397 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GOLGA8MH3BSY2 632 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NEMP1O14524 444 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC7A4O43246 635 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLU7O95391 586 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FGF1P05230 155 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CD6P30203 668 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 OXTRP30559 389 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ACSL1P33121 698 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HNF1BP35680 557 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAGEA6P43360 314 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DUPD1Q68J44 220 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LINC00523Q86TU6 105 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 WDR5BQ86VZ2 330 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LONP2Q86WA8 852 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SCRN2Q96FV2 425 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SPACA7Q96KW9 195 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 B4GALT6Q9UBX8 382 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FADS3Q9Y5Q0 445 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ESYT3A0FGR9 886 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AREL1O15033 823 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RHOXF2BP0C7M4 288 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SP9P0CG40 484 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TPH1P17752 444 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NFKBIAP25963 317 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MMP12P39900 470 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SUOXP51687 545 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ITGA8P53708 1063 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CDK16Q00536 496 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GUCY2DQ02846 1103 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ELP6Q0PNE2 266 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MTM1Q13496 603 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TEX35Q5T0J7 233 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DPPA4Q7L190 304 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PCGF5Q86SE9 256 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TSPAN33Q86UF1 283 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DNAAF3Q8N9W5 541 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RHOXF2Q9BQY4 288 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SGK2Q9HBY8 427 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PPIL1Q9Y3C6 166 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SPO11Q9Y5K1 396 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PLXNA2O75051 1894 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FANCMQ8IYD8 2048 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TBC1D3EA0A087X179 549 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LRRC72A6NJI9 287 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TBC1D3LB9A6J9 549 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AP1G1O43747 822 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NDUFS2O75306 463 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PCDH8O95206 1070 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SEMA4FO95754 770 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC4A1P02730 911 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TBC1D3HP0C7X1 549 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LHCGRP22888 699 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 VIPR1P32241 457 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CDH17Q12864 832 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RALGDSQ12967 914 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRADDQ15628 312 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF534Q76KX8 674 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HOOK3Q86VS8 718 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 OR2T34Q8NGX1 318 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GPR174Q9BXC1 333 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARNT2Q9HBZ2 717 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CASS4Q9NQ75 786 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ANAPC5Q9UJX4 755 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SHOC2Q9UQ13 582 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF711Q9Y462 761 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BPTFQ12830 3046 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TSPAN6O43657 245 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MMP20O60882 483 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms