RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 CTSEP14091 401 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 MX2P20592 715 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 KDELR1P24390 212 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 IGFALSP35858 605 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 GARSP41250 739 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEA1P43355 309 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 YPEL5P62699 121 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PPARDQ03181 441 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ACOX1Q15067 660 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SPA17Q15506 151 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SARM1Q6SZW1 724 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ENPP7Q6UWV6 458 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 FAM71BQ8TC56 605 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 BTN2A2Q8WVV5 523 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 RFFLQ8WZ73 363 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 RAPGEF5Q92565 580 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TSC1Q92574 1164 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 GATA6Q92908 595 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 NUDCD1Q96RS6 583 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 IL12RB2Q99665 862 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 NOD2Q9HC29 1040 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SPASTQ9UBP0 616 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 LRP4O75096 1905 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CFAP69A5D8W1 941 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TOR1BO14657 336 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 APOL1O14791 398 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SCAMP1O15126 338 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 MATN3O15232 486 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 AQP9O43315 295 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SPOPO43791 374 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 MFSD11O43934 449 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SOCS5O75159 536 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PEX11BO96011 259 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CPP00450 1065 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 KRT1P04264 644 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 KRT10P13645 584 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CCNCP24863 283 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 HNF1BP35680 557 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 MMP12P39900 470 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SLC1A1P43005 524 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ACADVLP49748 655 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PEX5P50542 639 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 BLKP51451 505 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ARSEP51690 589 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 EPHB1P54762 984 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 GALNT2Q10471 571 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf61Q13536 156 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGEF7Q14155 803 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 INPP5AQ14642 412 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 IRF4Q15306 451 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 LIPIQ6XZB0 460 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TMPRSS12Q86WS5 348 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 RFX6Q8HWS3 928 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 HID1Q8IV36 788 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PGBD5Q8N414 524 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 215.7 ms