RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559276.5

USP3-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 4

Gene USP3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-212ENST00000559276 SH3GL3Q99963 347 aa5.96□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 OMDQ99983 421 aa5.96□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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USP3-212ENST00000559276 TUBB6Q9BUF5 446 aa5.96□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 DPH5Q9H2P9 285 aa5.96□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa5.96□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 POPDC2Q9HBU9 364 aa5.96□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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USP3-212ENST00000559276 KLHL14Q9P2G3 628 aa5.96□□□□□ -1.46
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USP3-212ENST00000559276 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.96□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 RAI2Q9Y5P3 530 aa5.96□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 TENM4Q6N022 2769 aa5.96□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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USP3-212ENST00000559276 DOCK4Q8N1I0 1966 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 SHROOM3Q8TF72 1996 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa5.95□□□□□ -1.46
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USP3-212ENST00000559276 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 A0A1B0GVM2 712 aa5.95□□□□□ -1.46
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USP3-212ENST00000559276 E9PAM4 449 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 F5H5T6 163 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 K7ERQ8 282 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 MCF2LO15068 1137 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 RFPL3O75679 317 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 GRAP2O75791 330 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 CNTN5O94779 1100 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 UBOX5O94941 541 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 UNC5CO95185 931 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 TTC4O95801 387 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 ADH1BP00325 375 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 APOEP02649 317 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 PRB1P04280 392 aa5.95□□□□□ -1.46
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USP3-212ENST00000559276 TBC1D3HP0C7X1 549 aa5.95□□□□□ -1.46
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USP3-212ENST00000559276 ALDH3A1P30838 453 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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USP3-212ENST00000559276 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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USP3-212ENST00000559276 ACADSBP45954 432 aa5.95□□□□□ -1.46
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USP3-212ENST00000559276 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 PTP4A2Q12974 167 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 SLC12A1Q13621 1099 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 PTK6Q13882 451 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 LBRQ14739 615 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 STAT4Q14765 748 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 RTP5Q14D33 572 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 POM121L1PQ3SYA9 428 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 ALFQ53S48 1182 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 HES3Q5TGS1 186 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa5.95□□□□□ -1.46
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USP3-212ENST00000559276 PCSK4Q6UW60 755 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 OLFML1Q6UWY5 402 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 Q6ZVU0 165 aa5.95□□□□□ -1.46
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USP3-212ENST00000559276 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 PRELID2Q8N945 189 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 TMEM145Q8NBT3 493 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 SHC3Q92529 594 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 TBC1D31Q96DN5 1066 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 TRIM11Q96F44 468 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 SNF8Q96H20 258 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 TTC25Q96NG3 672 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-212ENST00000559276 AGPAT1Q99943 283 aa5.95□□□□□ -1.46
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