RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558970.2

GABPB1-208, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 1, human

TSL 5

Gene GABPB1, Length 730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GABPB1-208	ENST00000558970	HNF1B	P35680	557 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	FDFT1	P37268	417 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	ADCY8	P40145	1251 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	ERAP2	Q6P179	960 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	TADA1	Q96BN2	335 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	FEM1C	Q96JP0	617 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	TRIB3	Q96RU7	358 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	DPH5	Q9H2P9	285 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	SGK2	Q9HBY8	427 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	VPS45	Q9NRW7	570 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970		A0A0J9YYE9	177 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970		A0A1W2PQU0	124 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	NDST3	O95803	873 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	IGLV3-19	P01714	112 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	TRBC1	P01850	177 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	CTAGE8	P0CG41	777 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	TPH1	P17752	444 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	MAOB	P27338	520 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	HOXA6	P31267	233 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	MMP12	P39900	470 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	GRIA1	P42261	906 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	GRIA4	P48058	902 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	ELP6	Q0PNE2	266 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	SEMA5A	Q13591	1074 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	PTK6	Q13882	451 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	SLC1A5	Q15758	541 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	QPCT	Q16769	361 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	C8orf74	Q6P047	294 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	USP45	Q70EL2	814 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	FZD3	Q9NPG1	666 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	CACNA1A	O00555	2505 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	CCDC78	A2IDD5	438 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	IGLON5	A6NGN9	336 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	CAPN8	A6NHC0	703 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	AREL1	O15033	823 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	SLC7A4	O43246	635 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	CLDN7	O95471	211 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	AP2A1	O95782	977 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	ELFN1	P0C7U0	828 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	LHCGR	P22888	699 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	VIPR1	P32241	457 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	PTGER3	P43115	390 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	LIG3	P49916	1009 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	SLC7A5	Q01650	507 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	RALGDS	Q12967	914 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	TUBB2A	Q13885	445 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	SEPT6	Q14141	434 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	ARHGEF7	Q14155	803 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	ACOX1	Q15067	660 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	CNGA3	Q16281	694 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	LRRC66	Q68CR7	880 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GABPB1-208	ENST00000558970	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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