RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557638.1

RALGAPA1-218, Transcript of Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 1, human

TSL 2

Gene RALGAPA1, Length 586 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPA1-218	ENST00000557638	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	MDM4	O15151	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	ASNA1	O43681	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	MTA2	O94776	668 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	LARGE1	O95461	756 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	NFATC1	O95644	943 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	MCM2	P49736	904 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	ADPRH	P54922	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	PPAT	Q06203	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	HSCB	Q8IWL3	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	WASF1	Q92558	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	ZMYM6	O95789	1325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	NEURL1	O76050	574 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	CBSL	P0DN79	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	PEPD	P12955	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	HOXC13	P31276	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	AKT1	P31749	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	ARRB2	P32121	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	CBS	P35520	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	TEC	P42680	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	ARL4C	P56559	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	KRT83	P78385	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	STARD3	Q14849	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	POSTN	Q15063	836 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	LPAR1	Q92633	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	MECR	Q9BV79	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-218	ENST00000557638	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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