RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	SPEG	Q15772	3267 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A0U1RQS6	177 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	FPGT	O14772	594 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	FLRT2	O43155	660 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	MMP2	P08253	660 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CTPS1	P17812	591 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PEX5	P50542	639 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PFN3	P60673	137 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	FOXK2	Q01167	660 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	TFDP2	Q14188	446 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	FZD2	Q14332	565 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	AADACL2	Q6P093	401 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	DPPA4	Q7L190	304 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	HAUS1	Q96CS2	278 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	AMACR	Q9UHK6	382 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CHKB	Q9Y259	395 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	KNTC1	P50748	2209 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	LRP4	O75096	1905 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	FZD6	O60353	706 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	NEBL	O76041	1014 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	FTCD	O95954	541 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PRL	P01236	227 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	ITGAV	P06756	1048 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	ALPI	P09923	528 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	ELFN1	P0C7U0	828 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	TGM2	P21980	687 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	LHCGR	P22888	699 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CTNNA2	P26232	953 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PML	P29590	882 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	VIPR1	P32241	457 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	GRK6	P43250	576 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	RABIF	P47224	123 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	KIF5A	Q12840	1032 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRC14	Q15048	493 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CNGA3	Q16281	694 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PPP2R5E	Q16537	467 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	BBS12	Q6ZW61	710 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PELI3	Q8N2H9	469 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	OXR1	Q8N573	874 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	KLF15	Q9UIH9	416 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1W2PQ67	120 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC66	A2RUB6	948 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CFAP69	A5D8W1	941 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	YKT6	O15498	198 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PCCB	P05166	539 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PYGM	P11217	842 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CES1	P23141	567 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CD86	P42081	329 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	NR2C2	P49116	596 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	SKOR1	P84550	965 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	AGER	Q15109	404 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	GLRX5	Q86SX6	157 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6

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