RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	DLG2	Q15700	870 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	BOLA3	Q53S33	107 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	LRRC31	Q6UY01	552 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	CLPB	Q9H078	707 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PREB	Q9HCU5	417 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	NEU3	Q9UQ49	428 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	BUB1	O43683	1085 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	LRIG2	O94898	1065 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	MOCS3	O95396	460 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	CCDC175	P0C221	793 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	COL8A1	P27658	744 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	L1CAM	P32004	1257 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	CA9	Q16790	459 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TEKT4	Q8WW24	435 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	USP7	Q93009	1102 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PMEPA1	Q969W9	287 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ALG14	Q96F25	216 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	BOC	Q9BWV1	1114 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	USP29	Q9HBJ7	922 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	GPR27	Q9NS67	375 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	GULP1	Q9UBP9	304 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222		A6NNZ2	444 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	MCF2L	O15068	1137 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	MTSS1	O43312	755 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SRGAP2	O75044	1071 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	CLDN11	O75508	207 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	RARA	P10276	462 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	LIPC	P11150	499 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	COMT	P21964	271 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	HTR7	P34969	479 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	MAPK10	P53779	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TAS2R40	P59535	323 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SERINC3	Q13530	473 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	DPYSL2	Q16555	572 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ALF	Q53S48	1182 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	IL12RB2	Q99665	862 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ZWILCH	Q9H900	591 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	MPP6	Q9NZW5	540 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	GGT7	Q9UJ14	662 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PADI4	Q9UM07	663 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222	ALG6	Q9Y672	507 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CS-231	ENST00000552222		A1L4Q6	167 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	C9orf172	C9J069	976 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	YY2	O15391	372 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	KRT86	O43790	486 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	SNAP91	O60641	907 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	TCEA3	O75764	348 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	CNTN5	O94779	1100 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	KRT7	P08729	469 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	RHOQ	P17081	205 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CS-231	ENST00000552222	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18

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