RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 KMOO15229 486 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 KERAO60938 352 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 C5AR1P21730 350 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 UGT1A1P22309 533 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 RABIFP47224 123 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 RFX3P48380 749 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 CCT8P50990 548 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 DAOAP59103 153 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 ACY1Q03154 408 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 KCNMB4Q86W47 210 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 C16orf96A6NNT2 1141 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 BAG2O95816 211 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 CXCR5P32302 372 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 PRKCIP41743 596 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 RING1Q06587 406 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 PTPN21Q16825 1174 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 LCA5Q86VQ0 697 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 GJD3Q8N144 294 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 EMC1Q8N766 993 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 FAM162AQ96A26 154 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 TUBGCP3Q96CW5 907 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 ECSITQ9BQ95 431 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 ANKHQ9HCJ1 492 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 C4BP0C0L5 1744 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 A0A0J9YVX5 310 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PCCBP05166 539 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CD86P42081 329 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PLK1P53350 603 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SELENOVP59797 346 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PLGLB1Q02325 96 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 HSPA14Q0VDF9 509 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 DNAL1Q4LDG9 190 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ATCAYQ86WG3 371 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SIKE1Q9BRV8 207 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ING2Q9H160 280 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CALML5Q9NZT1 146 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SNX7Q9UNH6 387 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 AGPSO00116 658 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TOR1BO14657 336 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PMM2O15305 246 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 DGKIO75912 1065 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 KAT7O95251 611 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PRLRP16471 622 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ERCC2P18074 760 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 HOXA9P31269 272 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 VIPR1P32241 457 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ALDH9A1P49189 494 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PER3P56645 1201 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MMRN1Q13201 1228 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ITIH4Q14624 930 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ANXA8L1Q5VT79 327 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TTC23Q5W5X9 447 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ENPP7Q6UWV6 458 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PPP3R2Q96LZ3 170 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 C5orf34Q96MH7 638 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 L1RE1Q9UN81 338 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ASTN1O14525 1302 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MTMR11A4FU01 709 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 FAM170BA6NMN3 283 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 E9PAM4 449 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 GFRA2O00451 464 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CLEC3AO75596 197 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ME2P23368 584 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 DSG1Q02413 1049 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ALLCQ8N6M5 410 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms