RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525059.1

PTDSS2-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS2, Length 1,258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-202ENST00000525059 ZNF487B1APH4 448 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 NEBLO76041 1014 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 PRKCGP05129 697 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 GP1BAP07359 652 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 MMP13P45452 471 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 DAB2P98082 770 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 INPP5AQ14642 412 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 VSIG1Q86XK7 387 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 MAML1Q92585 1016 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 APOOQ9BUR5 198 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 AMACRQ9UHK6 382 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 INTUQ9ULD6 942 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.48■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 LMO7DNF2Z398 122 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 MFSD11O43934 449 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 CCNCP24863 283 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 TRIM23P36406 574 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 BLKP51451 505 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 PPARDQ03181 441 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 HES3Q5TGS1 186 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 PQLC3Q8N755 202 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 LMX1AQ8TE12 382 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.47■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 MATN3O15232 486 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 ZZEF1O43149 2961 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 GCATO75600 419 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 ELFN1P0C7U0 828 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 GM2AP17900 193 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 CES1P23141 567 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 KDELR1P24390 212 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 NFKBIAP25963 317 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 HTR1BP28222 390 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 SEMG2Q02383 582 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 NFATC4Q14934 902 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 FAXCQ5TGI0 409 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 LRRC38Q5VT99 294 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 RBFAQ8N0V3 343 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 ATL2Q8NHH9 583 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 MDM1Q8TC05 714 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 SCRN2Q96FV2 425 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 COQ10AQ96MF6 247 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 LRRC61Q9BV99 259 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 BOCQ9BWV1 1114 aa20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTDSS2-202ENST00000525059 PGLSO95336 258 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 MX2P20592 715 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 HK3P52790 923 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 MAXP61244 160 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 TRAF2Q12933 501 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 MESDQ14696 234 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 RTP5Q14D33 572 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 PAF1Q8N7H5 531 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 RAPGEF5Q92565 580 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 RNF157Q96PX1 679 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 IL12RB2Q99665 862 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 NRSN2Q9GZP1 204 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 CLPBQ9H078 707 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.45■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 LRRK1Q38SD2 2015 aa20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 OPA1O60313 960 aa20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 FZD6O60353 706 aa20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 RASGRP1O95267 797 aa20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 CPP00450 1065 aa20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 TSHRP16473 764 aa20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 GJC1P36383 396 aa20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 CLDN6P56747 220 aa20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 KIAA1024LP59773 190 aa20.44■□□□□ 0.86
PTDSS2-202ENST00000525059 CYP4F3Q08477 520 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms