RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519254.2

CLN8-204, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-204ENST00000519254 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 RGRP47804 291 aa14.57□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 SOX9P48436 509 aa14.57□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 RHOAP61586 193 aa14.57□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 MESP2Q0VG99 397 aa14.57□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.57□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.57□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 TMEM215Q68D42 235 aa14.57□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.57□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.57□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 SEPT6Q14141 434 aa14.57□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 DMC1Q14565 340 aa14.57□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 CNPY4Q8N129 248 aa14.57□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.57□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.57□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 FEM1CQ96JP0 617 aa14.57□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.57□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 HEATR9A2RTY3 570 aa14.56□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 MROH6A6NGR9 719 aa14.55□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 SRCP12931 536 aa14.55□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 IL9P15248 144 aa14.55□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.55□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.55□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 TRIB3Q96RU7 358 aa14.55□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa14.55□□□□□ -0.08
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CLN8-204ENST00000519254 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.55□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.55□□□□□ -0.08
CLN8-204ENST00000519254 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.55□□□□□ -0.08
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