RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 LPAL2Q16609 132 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 SOWAHAQ2M3V2 549 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 EDRF1Q3B7T1 1238 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNT1Q5JUK3 1230 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGAP17Q68EM7 881 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC35E4Q6ICL7 350 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 RGMBQ6NW40 437 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 GTSCR1Q86UQ5 136 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 KMT5CQ86Y97 462 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 DSELQ8IZU8 1212 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINS1Q8NG48 757 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC20A1Q8WUM9 679 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM170AQ8WVE7 144 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 RND1Q92730 232 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 C17orf75Q9HAS0 396 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 OGFRQ9NZT2 677 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCNAP12004 261 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITGA2P17301 1181 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD58P19256 250 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP8P40818 1118 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 NEK3P51956 506 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 TERF1P54274 439 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRIK2Q13002 908 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 LIN54Q6MZP7 749 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 GFRALQ6UXV0 394 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF852Q6ZMS4 543 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM219Q86XT9 240 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 GJC3Q8NFK1 279 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF524Q96C55 264 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNFT2Q96EX2 444 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF354BQ96LW1 612 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC1Q9BTT6 524 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNGB3Q9NQW8 809 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 PADI1Q9ULC6 663 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 NOTCH2Q04721 2471 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLRF2D3W0D1 207 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDH7O60245 1069 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 INHBAP08476 426 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHRNB4P30926 498 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 HNF1BP35680 557 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 SERPINF1P36955 418 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC18A3Q16572 532 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 MMEL1Q495T6 779 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 STXBP5Q5T5C0 1151 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRSS45Q7RTY3 260 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBC1D26Q86UD7 250 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 HCAR2Q8TDS4 363 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 MASTLQ96GX5 879 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATOH8Q96SQ7 321 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 FKRPQ9H9S5 495 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 DACT1Q9NYF0 836 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 RCOR1Q9UKL0 485 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRCH1Q9Y2L9 728 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 AMDHD2Q9Y303 409 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 A3GALT2U3KPV4 340 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A087WV62 115 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSPB2A8KAH6 182 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACKR2O00590 384 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAVIN2O95810 425 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 PATE4P0C8F1 98 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 NR1D1P20393 614 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 RYKP34925 604 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 MCM2P49736 904 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 CSRP3P50461 194 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 LMO4P61968 165 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSPB2Q16082 182 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 SFMBT2Q5VUG0 894 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC36A4Q6YBV0 504 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 HERC6Q8IVU3 1022 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR63Q8IWG1 891 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCCPDHQ8NBX0 429 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR6Y1Q8NGX8 325 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAGEC3Q8TD91 643 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 DUSP19Q8WTR2 217 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 RUBCNQ92622 972 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 C17orf77Q96MU5 243 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF570Q96NI8 536 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHODLQ9H9P2 273 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDH9Q9HC56 1237 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 NLRC4Q9NPP4 1024 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 G6PC2Q9NQR9 355 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms