RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 BFSP1Q12934 665 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TAF12Q16514 161 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ARMC6Q6NXE6 501 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 Q6ZS52 159 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 C14orf80Q86SX3 495 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 DAAM2Q86T65 1068 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM150AQ86TG1 271 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MON1AQ86VX9 555 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 EFCAB13Q8IY85 973 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MYEOVQ96EZ4 313 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SMC3Q9UQE7 1217 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ITPR1Q14643 2758 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 OBSL1O75147 1896 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MARCH11A6NNE9 402 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 HUS1O60921 280 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SOAT2O75908 522 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MAGEA11P43364 429 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 LHX1P48742 406 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MXRA7P84157 204 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MYL7Q01449 175 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 RUNX3Q13761 415 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 FGL2Q14314 439 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 PON2Q15165 354 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 WSCD1Q658N2 575 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 GGNQ86UU5 652 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SFR1Q86XK3 245 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 PDCL2Q8N4E4 241 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 FSIP1Q8NA03 581 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ATP2A3Q93084 1043 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SCAMP4Q969E2 229 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ZFYVE19Q96K21 471 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ACCSQ96QU6 501 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MED15Q96RN5 788 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 PKMYT1Q99640 499 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 HPS4Q9NQG7 708 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 EHD2Q9NZN4 543 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SCN1AP35498 2009 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 IGF2RP11717 2491 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SPEGQ15772 3267 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 GREB1Q4ZG55 1949 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 VSTM5A8MXK1 200 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 RPP40O75818 363 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MATN4O95460 622 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF806P0C7X5 589 aa7.17□□□□□ -1.26
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PDE4D-222ENST00000514552 PPP3CCP48454 512 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 RAB1AP62820 205 aa7.17□□□□□ -1.26
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PDE4D-222ENST00000514552 DMWDQ09019 674 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MYO1EQ12965 1108 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MTF1Q14872 753 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF77Q15935 545 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 VSTM1Q6UX27 236 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 C4orf50Q6ZRC1 276 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SYT13Q7L8C5 426 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 PPP1R3BQ86XI6 285 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 OSCP1Q8WVF1 389 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 CHFRQ96EP1 664 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SPATA17Q96L03 361 aa7.17□□□□□ -1.26
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