RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-208	ENST00000511439	SOCS2	O14508	198 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	TBX10	O75333	385 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	CNTN5	O94779	1100 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	BAIAP3	O94812	1187 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	CD4	P01730	458 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	TK1	P04183	234 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	SNHG28	P0DPA3	235 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	ARHGAP25	P42331	645 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	PCP4	P48539	62 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	RCAN1	P53805	252 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACTR2	P61160	394 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	GRB14	Q14449	540 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	TWIST1	Q15672	202 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	SYT13	Q7L8C5	426 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	AFG1L	Q8WV93	481 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM151A	Q8WW52	585 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	GOLGA1	Q92805	767 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	TEKT1	Q969V4	418 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRIM2	Q9C040	744 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	RCE1	Q9Y256	329 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	KIF16B	Q96L93	1317 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	SI	P14410	1827 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	LINC01553	A4QN01	128 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439		E5RJQ4	531 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	BCAR3	O75815	825 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	PLAU	P00749	431 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	SP9	P0CG40	484 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	CHN1	P15882	459 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	TGM2	P21980	687 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	RPS6KB1	P23443	525 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	RFC2	P35250	354 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	SOX2	P48431	317 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	HMGCS2	P54868	508 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	YPEL5	P62699	121 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	PDCL	Q13371	301 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	RABEP1	Q15276	862 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	UEVLD	Q8IX04	471 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	PIGK	Q92643	395 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	CUL5	Q93034	780 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	ATP2A3	Q93084	1043 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	PIGS	Q96S52	555 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	DOCK1	Q14185	1865 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	IGF2R	P11717	2491 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	EMSY	Q7Z589	1322 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	DSCR3	O14972	297 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	INPPL1	O15357	1258 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	CKMT1A	P12532	417 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	AKR1A1	P14550	325 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	ST6GAL1	P15907	406 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	CCKBR	P32239	447 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	HSF1	Q00613	529 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	CFHR1	Q03591	330 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	COASY	Q13057	564 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TOPBP1-208	ENST00000511439	SPP2	Q13103	211 aa		3.86	□□□□□ -1.79

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