RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa3.28□□□□□ -1.88
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SUFUQ9UMX1 484 aa3.28□□□□□ -1.88
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