RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	BECN2	A8MW95	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	AP3D1	O14617	1153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	LCAT	P04180	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	MMP2	P08253	660 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	TM4SF1	P30408	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	PMS2	P54278	862 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	PRKG2	Q13237	762 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	SHB	Q15464	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	TWIST1	Q15672	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SKAP2-208	ENST00000495802		H3BNX3	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	ITM2A	O43736	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	GFPT2	O94808	682 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	NDUFB4	O95168	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	LDHC	P07864	332 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	RARG	P13631	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	IL7R	P16871	459 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802		A6NCN8	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802		B4DGG1	531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	VWA5A	O00534	786 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	RGS14	O43566	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SPRY3	O43610	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SOX30	O94993	753 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	NKX2-2	O95096	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	TOMM40	O96008	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	HOXD13	P35453	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	HADHA	P40939	763 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	RFX2	P48378	723 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SORD	Q00796	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	HNF4G	Q14541	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	KLHL35	Q6PF15	583 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	TTC3	P53804	2025 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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