RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491013.5

FDPS-216, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene FDPS, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPS-216ENST00000491013 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.76□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.76□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.76□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.76□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 IL12RB2Q99665 862 aa14.76□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.76□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.76□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PPIL1Q9Y3C6 166 aa14.76□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.76□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 SPEGQ15772 3267 aa14.76□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PIAS2O75928 621 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 JCHAINP01591 159 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ELFN1P0C7U0 828 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 GM2AP17900 193 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 DGKAP23743 735 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 NFKBIAP25963 317 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 MARCKSL1P49006 195 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 NR2C2P49116 596 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 DYNLT1P63172 113 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 DSC2Q02487 901 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PTK2BQ14289 1009 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 IRF4Q15306 451 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 NPNTQ6UXI9 565 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PARGQ86W56 976 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 SLC25A45Q8N413 288 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 EID2Q8N6I1 236 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 EXD1Q8NHP7 514 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 KRT35Q92764 455 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 SCRN2Q96FV2 425 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 KCNK1O00180 336 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CST8O60676 142 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 SDC3O75056 442 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 NEBLO76041 1014 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CSF2P04141 144 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PDHA1P08559 390 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 KRT10P13645 584 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 VIPR1P32241 457 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PEX5P50542 639 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 THOP1P52888 689 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 13.3
FDPS-216ENST00000491013 ADCY2Q08462 1091 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 AP1B1Q10567 949 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ZBTB17Q13105 803 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 KIAA1328Q86T90 577 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CNTD1Q8N815 330 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 KLF15Q9UIH9 416 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 TTLL3Q9Y4R7 772 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 MYLKQ15746 1914 aa14.74□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ASXL3Q9C0F0 2248 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 A8MX80 341 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 GIMD1P0DJR0 217 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 TGM2P21980 687 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 GSDMDP57764 484 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 COPS2P61201 443 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 MTM1Q13496 603 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 INPP5AQ14642 412 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 LLGL1Q15334 1064 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CNGA3Q16281 694 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PPP2R5EQ16537 467 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 KAZNQ674X7 775 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 MACC1Q6ZN28 852 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.73□□□□□ -0.05
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