RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SENP6-210ENST00000487548 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
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SENP6-210ENST00000487548 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP2.7□□□□□ -1.989e-7■□□□□ 8.6
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SENP6-210ENST00000487548 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
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SENP6-210ENST00000487548 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 CCDC138Q96M89 665 aa2.69□□□□□ -1.98
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SENP6-210ENST00000487548 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
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SENP6-210ENST00000487548 ITGADQ13349 1161 aa2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 NEDD9Q14511 834 aa2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 IL31Q6EBC2 164 aa2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 C11orf96Q7Z7L8 435 aa2.68□□□□□ -1.98
SENP6-210ENST00000487548 ZNF440Q8IYI8 595 aa2.68□□□□□ -1.98
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