RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474346.1

TNS3-211, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TNS3, Length 775 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-211ENST00000474346 PCDH12Q9NPG4 1184 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 FOXJ2Q9P0K8 574 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 NEU3Q9UQ49 428 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 OR1A2Q9Y585 309 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 PTPN13Q12923 2485 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 C2CD4BA6NLJ0 364 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 WASH4PA8MWX3 477 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 FAM72CH0Y354 149 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 MMP8P22894 467 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 EPHB2P29323 1055 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 HTR7P34969 479 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 TRIM23P36406 574 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 ETV5P41161 510 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 CSNK1DP48730 415 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 AIF1P55008 147 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 NFKB2Q00653 900 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 SERINC3Q13530 473 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 EFHC2Q5JST6 749 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 FAM72AQ5TYM5 149 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 TAF3Q5VWG9 929 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 NAA35Q5VZE5 725 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 FAM72DQ6L9T8 149 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 SLFN11Q7Z7L1 901 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 VASH2Q86V25 355 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 FAM72BQ86X60 149 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 MLKLQ8NB16 471 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 CPA5Q8WXQ8 436 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 PDXPQ96GD0 296 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 SLC12A9Q9BXP2 914 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 STK33Q9BYT3 514 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 ANKMY1Q9P2S6 941 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 LHX3Q9UBR4 397 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 ANAPC2Q9UJX6 822 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 COQ6Q9Y2Z9 468 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS3-211ENST00000474346 LRRK1Q38SD2 2015 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 RHPN2P1A8MT19 583 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 B4DGG1 531 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 RASA4BC9J798 803 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 RASA4O43374 803 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 PCCBP05166 539 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 MMEP08473 750 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 ITIH2P19823 946 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 SERPINA4P29622 427 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 GPR3P46089 330 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 GSCP56915 257 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 B4GALNT1Q00973 533 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 NR1D2Q14995 579 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 VWA3BQ502W6 1294 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 C2CD6Q53TS8 623 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 TRIM72Q6ZMU5 477 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 ZNF438Q7Z4V0 828 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 EPS8L1Q8TE68 723 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 FAM172AQ8WUF8 416 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 HTR3CQ8WXA8 447 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 OR1E3Q8WZA6 343 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 UNC13CQ8NB66 2214 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 TMEM202A6NGA9 273 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 ELFN1P0C7U0 828 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 KRT3P12035 628 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 GP1BBP13224 206 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 UCHL3P15374 230 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 DESP17661 470 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 CCR10P46092 362 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 HDAC4P56524 1084 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 CDR2Q01850 454 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 KCNAB2Q13303 367 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 SQSTM1Q13501 440 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 CLCA4Q14CN2 919 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 C16orf72Q14CZ0 275 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 CYTH1Q15438 398 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 TCEA2Q15560 299 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 IL22RA1Q8N6P7 574 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 CCDC185Q8N715 623 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 AGBL5Q8NDL9 886 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 NKD1Q969G9 470 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TNS3-211ENST00000474346 EFHD1Q9BUP0 239 aa13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms