RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAF2Q12933 501 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 PTK2BQ14289 1009 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC14Q15048 493 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 GATAD2AQ86YP4 633 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 SAP25Q8TEE9 199 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 CENPTQ96BT3 561 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 OLFM3Q96PB7 478 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 DESI2Q9BSY9 194 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 GPR27Q9NS67 375 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 COQ6Q9Y2Z9 468 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 H3BM21 787 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 JCHAINP01591 159 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 HLA-DQB2P05538 268 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 CETN2P41208 172 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 MARCKSL1P49006 195 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 SEMG2Q02383 582 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 DSC2Q02487 901 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 RALGDSQ12967 914 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 AGERQ15109 404 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 IRF4Q15306 451 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 SHBQ15464 509 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP2R5EQ16537 467 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 NPNTQ6UXI9 565 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 LIPIQ6XZB0 460 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 USP45Q70EL2 814 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 GLRX5Q86SX6 157 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 PARGQ86W56 976 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 KRT35Q92764 455 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 P3H4Q92791 437 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 IL12RB2Q99665 862 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM16O95361 564 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 CTNNA2P26232 953 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 PMLP29590 882 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 VIPR1P32241 457 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 EPHB1P54762 984 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 RWDD2BP57060 319 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 PFN3P60673 137 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 BNIP3Q12983 259 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGEF7Q14155 803 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 ACOX1Q15067 660 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 LLGL1Q15334 1064 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 HS1BP3Q53T59 392 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC181Q5TID7 509 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 AMFRQ9UKV5 643 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 LRP4O75096 1905 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPRBP23467 1997 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 A8MX80 341 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGAP6O43182 974 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 MTSS1O43312 755 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 TNFSF14O43557 240 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 NRDCO43847 1150 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 SDC3O75056 442 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 FOXC1Q12948 553 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 ZBTB17Q13105 803 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 MTM1Q13496 603 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 FZD2Q14332 565 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 PEX26Q7Z412 305 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 EID2Q8N6I1 236 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 ATL2Q8NHH9 583 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 SCRN2Q96FV2 425 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms