RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZSWIM9Q86XI8 627 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 PEX13Q92968 403 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 C9orf72Q96LT7 481 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 HDAC8Q9BY41 377 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D17Q9HA65 648 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD248Q9HCU0 757 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIMKLBQ9ULI2 386 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCML1Q9UN30 329 aa17.02■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYOFQ9NZM1 2061 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 MROH6A6NGR9 719 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 UPK3BL1B0FP48 263 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 UPK3BL2E5RIL1 263 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIPK2O43353 540 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP1O94782 785 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 C5AR1P21730 350 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 XPAP23025 273 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSMD8P48556 350 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 COPAP53621 1224 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB16Q05516 673 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEPT6Q14141 434 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPANXN3Q5MJ09 141 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 STEAP4Q687X5 459 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA1211LQ6NV74 962 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYT13Q7L8C5 426 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTC7BQ86TV6 843 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 C19orf43Q9BQ61 176 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHRAC1Q9NRG0 131 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPO11Q9Y5K1 396 aa17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHROOM3Q8TF72 1996 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 C2orf81A6NN90 581 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 LDB2O43679 373 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABHD2P08910 425 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALPIP09923 528 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIRTP0C851 137 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 TIMP2P16035 220 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTPS1P17812 591 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 HNF1BP35680 557 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSD17B3P37058 310 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABL2P42684 1182 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEK3P51956 506 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS14P62263 151 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 FZD5Q13467 585 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRY1Q16526 586 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERAP2Q6P179 960 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXL19Q6PCT2 694 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 UNC5AQ6ZN44 842 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYS1Q717R9 158 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 PJA1Q8NG27 643 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSDMBQ8TAX9 411 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB7BQ96AH8 199 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARRDC3Q96B67 414 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFAP36Q96G28 342 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOXQ1Q9C009 403 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS37BQ9H9H4 285 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF711Q9Y462 761 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa17■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACSL3O95573 720 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNTTP04053 509 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRKCGP05129 697 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF30P17039 623 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAMP19021 973 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL9A1P20849 921 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 HMGCLP35914 325 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS9P46781 194 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 DGKEP52429 567 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPX6P59796 221 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIGLEC14Q08ET2 396 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ELP6Q0PNE2 266 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRYMQ14894 314 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 SKIDA1Q1XH10 827 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 POM121L1PQ3SYA9 428 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSTD2Q5T7W7 516 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZS52 159 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMPRSS6Q8IU80 811 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 MDGA1Q8NFP4 955 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 STYXQ8WUJ0 223 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLDN23Q96B33 292 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR63Q9BZJ6 419 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARL5AQ9Y689 179 aa16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms