RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MKS1Q9NXB0 559 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PLK2Q9NYY3 685 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CCL26Q9Y258 94 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PATJQ8NI35 1801 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SZT2Q5T011 3432 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PLXNA3P51805 1871 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 VWA8A3KMH1 1905 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC78A2IDD5 438 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MROH6A6NGR9 719 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ERICH4A6NGS2 130 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 C2orf81A6NN90 581 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SLC7A4O43246 635 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RFPL1O75677 317 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PAPLNO95428 1278 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PRAMEF12O95522 483 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ASMTLO95671 621 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 IGSF6O95976 241 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MPOP05164 745 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ITGA2BP08514 1039 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 FBXO45P0C2W1 286 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NEFHP12036 1026 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CR2P20023 1033 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TYK2P29597 1187 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CD70P32970 193 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CRHR1P34998 444 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CCNFP41002 786 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RGRP47804 291 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CD151P48509 253 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CSNK1DP48730 415 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 LIMK2P53671 638 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SEC24CP53992 1094 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 EPHB1P54762 984 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PRAMEP78395 509 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 DMTNQ08495 405 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 LMAN2Q12907 356 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ZSCAN26Q16670 478 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NEPROQ6NW34 567 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM25Q86YD3 366 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RNF135Q8IUD6 432 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 APCDD1Q8J025 514 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PAF1Q8N7H5 531 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ITFG1Q8TB96 612 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ING5Q8WYH8 240 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PEX13Q92968 403 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 EXOC2Q96KP1 924 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF778Q96MU6 729 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TRIB3Q96RU7 358 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 AGAP2Q99490 1192 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RBBP8Q99708 897 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 BBS2Q9BXC9 721 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 IGFLR1Q9H665 355 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TREX1Q9NSU2 369 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 HACD3Q9P035 362 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 LHX3Q9UBR4 397 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GGA2Q9UJY4 613 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TLK1Q9UKI8 766 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CHKBQ9Y259 395 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PSAT1Q9Y617 370 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 HMX2A2RU54 273 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.66□□□□□ -1.34
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