RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 LONP1P36776 959 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 ME1P48163 572 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 DEFB103AP81534 67 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 MGAT3Q09327 533 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 GPNMBQ14956 572 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 SLC39A14Q15043 492 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 TMTC4Q5T4D3 741 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 SEPT8Q92599 483 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 PRO3102Q9H379 93 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 PLXNA3P51805 1871 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 H7C4K7 107 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 YEATS4O95619 227 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CXCL10P02778 98 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 ID2Q02363 134 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 CAPSQ13938 189 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 KCNB1Q14721 858 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 VSTM1Q6UX27 236 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 FAM228AQ86W67 206 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 LRRC15Q8TF66 581 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 NSMCE1Q8WV22 266 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 TCP11Q8WWU5 503 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 STAMQ92783 540 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 AK8Q96MA6 479 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 MINDY3Q9H8M7 445 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CPNE7Q9UBL6 633 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 MGAT4CQ9UBM8 478 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF580Q9UK33 172 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CFAP45Q9UL16 551 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 PADI3Q9ULW8 664 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 BAIAP3O94812 1187 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRK-209ENST00000415046 PLA2G4BP0C869 781 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 HGFP14210 728 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 MYOGP15173 224 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CYP11B2P19099 503 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 MUTP22033 750 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 GLRA2P23416 452 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 DDIT3P35638 169 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 GATMP50440 423 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 PEX3P56589 373 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 NUCB2P80303 420 aa4.72□□□□□ -1.65
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