RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 SLC35F3Q8IY50 421 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 CEP57L1Q8IYX8 460 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 SCML4Q8N228 414 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 EXOC1Q9NV70 894 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 IL36AQ9UHA7 158 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 SARDHQ9UL12 918 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 GPR34Q9UPC5 381 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 PLAAQ9Y263 795 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 U3KQA8 63 aa8.01□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 CACNA1DQ01668 2161 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 C2CD3Q4AC94 2353 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 EFCAB7A8K855 629 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 PDXKO00764 312 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 MAPK13O15264 365 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 YY2O15391 372 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 TSPAN6O43657 245 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 IGLV3-27P01718 113 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 VDRP11473 427 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 VAV1P15498 845 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 TACR2P21452 398 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 DAOAP59103 153 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 DLG4P78352 724 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 CCL7P80098 99 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 C1orf61Q13536 156 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 RABEP1Q15276 862 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 STILQ15468 1287 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 MAP9Q49MG5 647 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 DENND6BQ8NEG7 585 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 UBA3Q8TBC4 463 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 FRS2Q8WU20 508 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 CPLX3Q8WVH0 158 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 RAB7BQ96AH8 199 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 BMFQ96LC9 184 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 NOX5Q96PH1 765 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 CDH19Q9H159 772 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 PRDM8Q9NQV8 689 aa8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 RP1P56715 2156 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 POM121BA6NF01 834 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 CLDN11O75508 207 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 DNA2P51530 1060 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 RAD23BP54727 409 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 TAS2R38P59533 333 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 ENPEPQ07075 957 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 SLC39A14Q15043 492 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 NADSYN1Q6IA69 706 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 PIM3Q86V86 326 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 HID1Q8IV36 788 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 TAS1R2Q8TE23 839 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 TMX3Q96JJ7 454 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 HSFY1Q96LI6 401 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 TAAR9Q96RI9 348 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 MED15Q96RN5 788 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 DMAC2Q9NW81 257 aa7.99□□□□□ -1.13
CASP4-201ENST00000393150 RAB20Q9NX57 234 aa7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms