RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PADI1Q9ULC6 663 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 NENFQ9UMX5 172 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM169AQ9Y6X4 670 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR2A25A4D2G3 310 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 A6NNC1 897 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 A8MV72 311 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 H7C0S8 307 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP6CO00743 305 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 HS6ST1O60243 411 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 TPPPO94811 219 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MMP2P08253 660 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 TFPIP10646 304 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM11P17152 192 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SAT1P21673 171 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PON1P27169 355 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CERS1P27544 350 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHATP28329 748 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACADLP28330 430 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PIK3CAP42336 1068 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 NRIP1P48552 1158 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 GALCP54803 685 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ELLP55199 621 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMPRSS3P57727 454 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ID2Q02363 134 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACSM2AQ08AH3 577 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 IKQ13123 557 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 LAMB3Q13751 1172 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 LPIN1Q14693 890 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 KYNUQ16719 465 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM266Q2M3C6 531 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SOWAHAQ2M3V2 549 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 C6orf10Q5SRN2 563 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACSM2BQ68CK6 577 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CES5AQ6NT32 575 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 LINGO2Q7L985 606 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 TSPAN33Q86UF1 283 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 KBTBD6Q86V97 674 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNAAF5Q86Y56 855 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 WDR63Q8IWG1 891 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SFTPA2Q8IWL1 248 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM217AQ8IXS0 508 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC13Q8IYE1 715 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 RBFAQ8N0V3 343 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PARP16Q8N5Y8 322 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZBTB2Q8N680 514 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC44A5Q8NCS7 719 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 BEST2Q8NFU1 509 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CEP76Q8TAP6 659 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 BICD2Q8TD16 824 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 NELL1Q92832 810 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM18Q96B42 140 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 RADILQ96JH8 1075 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 NCAPGQ9BPX3 1015 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MSTO1Q9BUK6 570 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCED1AQ9H1Q7 454 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLK3Q9H4B4 646 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAP6D1Q9H9H5 199 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 LTB4R2Q9NPC1 389 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MSRB1Q9NZV6 116 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 RAI2Q9Y5P3 530 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CEPT1Q9Y6K0 416 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAU2Q9Y6X3 613 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A1W2PPC1 479 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A1W2PR77 199 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM202A6NGA9 273 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF814B7Z6K7 855 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 E5RJQ4 531 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 STMND1H3BQB6 276 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCER2I3L3R5 266 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 MDM4O15151 490 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADAMDEC1O15204 470 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 MITFO75030 526 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATG13O75143 517 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 DAB1O75553 588 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 FTCDO95954 541 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHRNB1P11230 501 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYF6P23409 242 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RNU6-655P-201ENST00000362858 AVPR1AP37288 418 aa2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms