RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SCN2BO60939 215 aa22.45■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 GNRH1P01148 92 aa22.45■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 CDK18Q07002 472 aa22.45■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SPESP1Q6UW49 350 aa22.45■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 STK32AQ8WU08 396 aa22.45■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 CKAP2Q8WWK9 683 aa22.45■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SNX15Q9NRS6 342 aa22.45■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 KLRC4O43908 158 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 OTCP00480 354 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PSME3P61289 254 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PANX1Q96RD7 426 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.181e-6■□□□□ 10.1
PTPRM-201ENST00000332175 CERS4Q9HA82 394 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 XPR1Q9UBH6 696 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 DISP2A7MBM2 1401 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 SLC28A2O43868 658 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 FLT3LGP49771 235 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 RHAGQ02094 409 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 FANCEQ9HB96 536 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 CARNS1A5YM72 827 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 TEX28O15482 410 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 MMP3P08254 477 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 CDC25CP30307 473 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 LSM3P62310 102 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 TTPALQ9BTX7 342 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 GULP1Q9UBP9 304 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ITGB5P18084 799 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 AUHQ13825 339 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC38Q5VT99 294 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PCYOX1Q9UHG3 505 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 USP46P62068 366 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 HIPK1Q86Z02 1210 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 EPHA3P29320 983 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PMF1Q6P1K2 205 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 FNDC11Q9BVV2 318 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 SPAG4Q9NPE6 437 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 CIDEBQ9UHD4 219 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 AP3M1Q9Y2T2 418 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 OR10H3O60404 316 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ITPKAP23677 461 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 KCTD21Q4G0X4 260 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.44■■□□□ 1.18
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PTPRM-201ENST00000332175 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 EPB41L1Q9H4G0 881 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 GMIPQ9P107 970 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PSMD8P48556 350 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL12Q53G59 568 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 CHADLQ6NUI6 762 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ART4Q93070 314 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 NUAK2Q9H093 628 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PPTC7Q8NI37 304 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 RCCD1A6NED2 376 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 CST1P01037 141 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 RPTNQ6XPR3 784 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PTGFRNQ9P2B2 879 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ERN1O75460 977 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 TNK2Q07912 1038 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ITGA7Q13683 1181 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 PCCBP05166 539 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 LIPMQ5VYY2 423 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 CLHC1Q8NHS4 586 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 SLC38A2Q96QD8 506 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 BST1Q10588 318 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 AKIRIN2Q53H80 203 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ABCG4Q9H172 646 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRM-201ENST00000332175 ACSS2Q9NR19 701 aa22.43■■□□□ 1.18
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