RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 FAM187AA6NFU0 413 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 TNFRSF10AO00220 468 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 PRNPP04156 253 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 ACADMP11310 421 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 FDFT1P37268 417 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 CXCL12P48061 93 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 GEMP55040 296 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 CALCOCO2Q13137 446 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 MPP3Q13368 585 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 SEL1L3Q68CR1 1132 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 PELI3Q8N2H9 469 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 SPEM1Q8N4L4 309 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 ECHDC3Q96DC8 303 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 MFSD3Q96ES6 412 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 NELL2Q99435 816 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 RAB17Q9H0T7 212 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 FZD3Q9NPG1 666 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 EML5Q05BV3 1969 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 LRRK1Q38SD2 2015 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPA-201ENST00000260116 K7ESF4 209 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 MMP20O60882 483 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CPP00450 1065 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 PRSS56P0CW18 603 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 PPP2CBP62714 309 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 PPP2CAP67775 309 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 LRRC66Q68CR7 880 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 KDM1BQ8NB78 822 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 OR13C4Q8NGS5 318 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 LRRC45Q96CN5 670 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 C9orf72Q96LT7 481 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 PARD6BQ9BYG5 372 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 LRRC40Q9H9A6 602 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 DYRK4Q9NR20 520 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CHMP2BQ9UQN3 213 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CA5BQ9Y2D0 317 aa10.9□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 A0A0J9YYE9 177 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 OR51F1A6NGY5 319 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 PCDH8O95206 1070 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TRBC1P01850 177 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 XPAP23025 273 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ZBED8Q8IZ13 594 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ARFGAP3Q9NP61 516 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 VPS45Q9NRW7 570 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 SLC17A6Q9P2U8 582 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D3EA0A087X179 549 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 GOLGA6CA6NDK9 693 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 GOLGA6BA6NDN3 693 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D3LB9A6J9 549 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 NDST3O95803 873 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D3HP0C7X1 549 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 GOLGA6DP0CG33 693 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ITGB7P26010 798 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 MAOBP27338 520 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ETV3P41162 512 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 RPS9P46781 194 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 FNTBP49356 437 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ADPRHP54922 357 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 LPAL2Q16609 132 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ALS2CLQ60I27 953 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 CRTC1Q6UUV9 634 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 LAYNQ6UX15 382 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ARMCX6Q7L4S7 300 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 SYNPOQ8N3V7 929 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 TMIEQ8NEW7 156 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 ART4Q93070 314 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 SCAMP4Q969E2 229 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 RUNDC3BQ96NL0 473 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPA-201ENST00000260116 GDF3Q9NR23 364 aa10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms