RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 DPYSQ14117 519 aa20.31■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 PTK2BQ14289 1009 aa20.31■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 NUP93Q8N1F7 819 aa20.31■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 VPS39Q96JC1 886 aa20.31■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 SCYL1Q96KG9 808 aa20.31■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ABCC13Q9NSE7 274 aa20.31■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.31■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa20.31■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.31■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 SCNN1BP51168 640 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 KCNMB4Q86W47 210 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 NPAS2Q99743 824 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 TTPALQ9BTX7 342 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 SIK2Q9H0K1 926 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 RRN3Q9NYV6 651 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ADA2Q9NZK5 511 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 MTMR11A4FU01 709 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 H0YJX3 145 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 CSF2RAP15509 400 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ZNF23P17027 643 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 NAGLUP54802 743 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 SCAPQ12770 1279 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 DUSP4Q13115 394 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 SEMA3BQ13214 749 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ANO4Q32M45 955 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.3■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 OR6C75A6NL08 312 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 AP2A1O95782 977 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 HADHAP40939 763 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 GJA8P48165 433 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 TPI1P60174 286 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 NRF1Q16656 503 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 IL23RQ5VWK5 629 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 TRIM74Q86UV6 250 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 TRIM73Q86UV7 250 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 C8orf48Q96LL4 319 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 VN1R3Q9BXE9 311 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 CWH43Q9H720 699 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 DCLK1O15075 740 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 TBC1D4O60343 1298 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 IGLV3-25P01717 112 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 IMPDH2P12268 514 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 GALK1P51570 392 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 DEFB103AP81534 67 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 TMED1Q13445 227 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 FAM156AQ8NDB6 213 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ATP6V1E2Q96A05 226 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ASB9Q96DX5 294 aa20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 KCNK1O00180 336 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 LRIG2O94898 1065 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 GPR17Q13304 367 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 MFSD3Q96ES6 412 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 GMIPQ9P107 970 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 RNF11Q9Y3C5 154 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 AP4S1Q9Y587 144 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 A0A1B0GTW7 788 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 IRAK2O43187 625 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 TBX18O95935 607 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 SAT1P21673 171 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 EMP3P54852 163 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 AIF1P55008 147 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 NPWQ8N729 165 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ZNF597Q96LX8 424 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 COQ10BQ9H8M1 238 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 CASS4Q9NQ75 786 aa20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 JUNP05412 331 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 ACRP10323 421 aa20.27■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 GLRBP48167 497 aa20.27■□□□□ 0.84
VGF-201ENST00000249330 CDK9P50750 372 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms