RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Plpp3Q99JY8 312 aa30.6■■■□□ 2.49
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sars2Q9JJL8 518 aa30.6■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cacna1hO88427 2365 aa30.6■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trim30aP15533 496 aa30.59■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wnt3aP27467 352 aa30.59■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nckap1P28660 1128 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prss57Q14B24 284 aa30.59■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gpr174Q3U507 335 aa30.59■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nlrp4eQ66X19 978 aa30.59■■■□□ 2.49
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Glipr1l1Q9DAG6 236 aa30.59■■■□□ 2.49
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CalcrlQ9R1W5 463 aa30.59■■■□□ 2.49
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr667Q7TRP4 326 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Scara3Q8C850 606 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Impg1Q8R1W8 798 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sike1Q9CPR7 207 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Acot13Q9CQR4 140 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tspan11Q9D1D1 253 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Polr3cQ9D483 533 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ppil6Q9D6D8 278 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gria4Q9Z2W8 902 aa30.58■■■□□ 2.49
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp846G3X996 541 aa30.58■■■□□ 2.49
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Washc5Q8C2E7 1159 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wdr26Q8C6G8 641 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem198bQ8CFU0 350 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hbp1Q8R316 516 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TfQ921I1 697 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 ProzQ9CQW3 399 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slco6d1Q9D5W6 683 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cbx8Q9QXV1 362 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Crybg1A0A0G2JG52 2065 aa30.58■■■□□ 2.49
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn2r14E9Q759 848 aa30.57■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 HelqQ2VPA6 1069 aa30.57■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Osgin2Q3TEE9 550 aa30.57■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccdc114Q3UX62 658 aa30.57■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fzd4Q61088 537 aa30.57■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sema4aQ62178 760 aa30.57■■■□□ 2.48
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dbn1Q9QXS6 706 aa30.57■■■□□ 2.48
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sh3pxd2bA2AAY5 908 aa30.56■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hoxa4P06798 285 aa30.56■■■□□ 2.48
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 DesP31001 469 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 McuQ3UMR5 350 aa30.56■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mfsd3Q5U419 412 aa30.56■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Phc1Q64028 1012 aa30.56■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Msantd1Q8BIL2 278 aa30.56■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 SgtaQ8BJU0 315 aa30.56■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp773Q9CZ29 471 aa30.56■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 DynapQ9D7M5 161 aa30.56■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Edf1Q9JMG1 148 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 DmdP11531 3678 aa30.56■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ttc30a2A2AKQ8 664 aa30.55■■■□□ 2.48
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm3159K7N760 267 aa30.55■■■□□ 2.48
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abl2Q4JIM5 1182 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgef15Q5FWH6 849 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mettl20Q80ZM3 255 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adgre4Q91ZE5 689 aa30.55■■■□□ 2.48
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ttc30bQ9CY00 664 aa30.55■■■□□ 2.48
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r49Q9WUF1 310 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm28729A0A1B0GSW2 409 aa30.55■■■□□ 2.48
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cbfa2t3O54972 620 aa30.55■■■□□ 2.48
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 P01671 111 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 P01672 111 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ctps1P70698 591 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Grb7Q03160 535 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Scrn3Q3TMH2 418 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam131bQ3TY60 332 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Itpripl2Q3UV16 535 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ip6k1Q6PD10 433 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 FicdQ8BIX9 458 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam204aQ8C6C7 236 aa30.55■■■□□ 2.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Grhl1Q921D9 618 aa30.55■■■□□ 2.48
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