RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 C12orf40Q86WS4 652 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 CDKL2Q92772 493 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 FAM50BQ9Y247 325 aa20.13■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 HMX2A2RU54 273 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 CBX4O00257 560 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ARNTLO00327 626 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 MATN3O15232 486 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 KDELR3O43731 214 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 MGAT1P26572 445 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ETFBP38117 255 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 RASSF2P50749 326 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 OXCT1P55809 520 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 IL10RBQ08334 325 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 MROH9Q5TGP6 573 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 SAR1AQ9NR31 198 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 FBXO10Q9UK96 956 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.12■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 SNAP91O60641 907 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 PRAMEF11O60813 436 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 CRHR1P34998 444 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 SLC6A11P48066 632 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ARFIP2P53365 341 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 PLEKHG6Q3KR16 790 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ATG16L1Q676U5 607 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 NDUFAF2Q8N183 169 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 USP33Q8TEY7 942 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 TMEM237Q96Q45 408 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 HAO1Q9UJM8 370 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 A0A0G2JND7 137 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 TULP3O75386 442 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 PEX11BO96011 259 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 JCHAINP01591 159 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ASGR2P07307 311 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 GJA4P35212 333 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 CRADDP78560 199 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ZBTB17Q13105 803 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 SLC12A1Q13621 1099 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 PID1Q7Z2X4 250 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ARMC2Q8NEN0 867 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 PDFQ9HBH1 243 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ACTL7AQ9Y615 435 aa20.11■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 MTSS1O43312 755 aa20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 CISD3P0C7P0 127 aa20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 T-ENOLP0DO92 83 aa20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 PTPN3P26045 913 aa20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 DGKGP49619 791 aa20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 PLK1P53350 603 aa20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 CRYMQ14894 314 aa20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 PITRM1Q5JRX3 1037 aa20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ACMSDQ8TDX5 336 aa20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 NXPE3Q969Y0 559 aa20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 SYBUQ9NX95 663 aa20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 BIRC5O15392 142 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ZMPSTE24O75844 475 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ARF5P84085 180 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 FUT11Q495W5 492 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 TEX44Q53QW1 395 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 LINGO4Q6UY18 593 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 C7orf26Q96N11 449 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 KCNK13Q9HB14 408 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 HEY2Q9UBP5 337 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 VPS51Q9UID3 782 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 DNAJC6O75061 913 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 POLBP06746 335 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 MESP2Q0VG99 397 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 GEN1Q17RS7 908 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 SPANXN3Q5MJ09 141 aa20.09■□□□□ 0.81
CLN8-208ENST00000635751 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms