RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619037.1

CYFIP1-209, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene CYFIP1, Length 575 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-209ENST00000619037 PRLP01236 227 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 LMNAP02545 664 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 CA4P22748 312 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 ITPKAP23677 461 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 STIP1P31948 543 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 SUOXP51687 545 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 EPHB1P54762 984 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 CREB5Q02930 508 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 GALNT3Q14435 633 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 SPDYCQ5MJ68 293 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 FAXCQ5TGI0 409 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 SEL1L3Q68CR1 1132 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 LAIR1Q6GTX8 287 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 ERAP2Q6P179 960 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 KDELC1Q6UW63 502 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 GSTA5Q7RTV2 222 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 CYP2U1Q7Z449 544 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 GLIS1Q8NBF1 620 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 LPCAT1Q8NF37 534 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 PIH1D2Q8WWB5 315 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 FOXJ1Q92949 421 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 IFT43Q96FT9 208 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 GORASP1Q9BQQ3 440 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 PCED1AQ9H1Q7 454 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 HOMER3Q9NSC5 361 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 FAM153AQ9UHL3 310 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 MUC6Q6W4X9 2439 aa13.14□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 PLXNA2O75051 1894 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 IGLON5A6NGN9 336 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 TSPAN6O43657 245 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 MMP20O60882 483 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 PHF2O75151 1096 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 METTL18O95568 372 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 ALPIP09923 528 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 CCR5P51681 352 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 WNT3AP56704 352 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 CDK18Q07002 472 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 ELP6Q0PNE2 266 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 RALGDSQ12967 914 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 PRPSAP1Q14558 356 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 SLC14A2Q15849 920 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 CCDC6Q16204 474 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 P3H1Q32P28 736 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 SYCP2LQ5T4T6 812 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 NEK5Q6P3R8 708 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 TTC27Q6P3X3 843 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 TRIM69Q86WT6 500 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 HORMAD1Q86X24 394 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 CCDC89Q8N998 374 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 IPMKQ8NFU5 416 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 CXorf40AQ8TE69 158 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 ZNF592Q92610 1267 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 PIGKQ92643 395 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 RMDN1Q96DB5 314 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 RTP4Q96DX8 246 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 FEM1CQ96JP0 617 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 TRIB3Q96RU7 358 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 EBF2Q9HAK2 575 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 TMEM74BQ9NUR3 256 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 B4GALT6Q9UBX8 382 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa13.13□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 SPAG17Q6Q759 2223 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 A0A0J9YYE9 177 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 A0A0U1RQS6 177 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 GOLGA8CPA6NN73 597 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 C10orf142B7Z368 130 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 PROB1E7EW31 1015 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 SLC31A1O15431 190 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 ANXA9O76027 345 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 EPN2O95208 641 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 TRBC1P01850 177 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 ACTN2P35609 894 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 HNF1BP35680 557 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 COILP38432 576 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 MMP12P39900 470 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 PAFAH1B1P43034 410 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 LIG3P49916 1009 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 GEMP55040 296 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 RPS21P63220 83 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 MPP3Q13368 585 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 OLIG2Q13516 323 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 CYP1B1Q16678 543 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 QPCTQ16769 361 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 PARP6Q2NL67 630 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 ZNF284Q2VY69 593 aa13.12□□□□□ -0.31
CYFIP1-209ENST00000619037 TMEM52BQ4KMG9 183 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms