RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613107.1

U6.58-201, humanhuman

BASIC

Gene U6, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.58-201ENST00000613107 FAM90A1Q86YD7 464 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 P3H2Q8IVL5 708 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 CPA6Q8N4T0 437 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 LINC00304Q8N9R0 145 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 EXD1Q8NHP7 514 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 LINC01006Q8NI28 216 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 DNAJB14Q8TBM8 379 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 KCNG4Q8TDN1 519 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 SMARCD2Q92925 531 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ELSPBP1Q96BH3 223 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 CLPTM1LQ96KA5 538 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 TNIP3Q96KP6 325 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 LRFN5Q96NI6 719 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 GPR78Q96P69 363 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 SIX2Q9NPC8 291 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 NOX4Q9NPH5 578 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ERAP1Q9NZ08 941 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 XPR1Q9UBH6 696 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 STEAP1Q9UHE8 339 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ACAD8Q9UKU7 415 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 VPS4AQ9UN37 437 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ERVK-11Q9UQG0 969 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 TNFSF13BQ9Y275 285 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ZNF510Q9Y2H8 683 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 KLHL20Q9Y2M5 609 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 GPR179Q6PRD1 2367 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ASTN1O14525 1302 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 MEGF6O75095 1541 aa-0.69□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ASB14A6NK59 587 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 KCNJ18B7U540 433 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 PDXKO00764 312 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 SYNGR3O43761 229 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ZNF861PO60384 105 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 SRGAP2O75044 1071 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 WDR1O75083 606 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 MMP3P08254 477 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 FAM153BP0C7A2 387 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 FTH1P19P0C7X4 201 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 JMJD7P0C870 316 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 CGB7P0DN87 165 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 TGM2P21980 687 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ITGA3P26006 1051 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 PTPN3P26045 913 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 SMARCA1P28370 1054 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 CHRNA5P30532 468 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 DPP6P42658 865 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 AGTR2P50052 363 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 GATMP50440 423 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 SNAPC2Q13487 334 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 TDGQ13569 410 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 PTPN21Q16825 1174 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 Q1RN00 199 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 GTDC1Q4AE62 458 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 GALNT17Q6IS24 598 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 SASS6Q6UVJ0 657 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 CROCCP3Q8IVE0 287 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 HSCBQ8IWL3 235 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 NXPE1Q8N323 547 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ZNF491Q8N8L2 437 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 LRRC15Q8TF66 581 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 TMEM18Q96B42 140 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ARSGQ96EG1 525 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 MAGED4Q96JG8 741 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 SLC45A3Q96JT2 553 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 USP28Q96RU2 1077 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 KRT12Q99456 494 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 C16orf70Q9BSU1 422 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 CLEC7AQ9BXN2 247 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 TRIM5Q9C035 493 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 SGK2Q9HBY8 427 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 SPTLC3Q9NUV7 552 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 TMEM51Q9NW97 253 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 C1RLQ9NZP8 487 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 SLC9A2Q9UBY0 812 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 FBXL17Q9UF56 701 aa-0.7□□□□□ -2.52
U6.58-201ENST00000613107 INTUQ9ULD6 942 aa-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.9 ms