RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 ST8SIA6P61647 398 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 ARF5P84085 180 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNC4Q03721 635 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 AP1B1Q10567 949 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf54Q8WWF1 131 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 LGMNQ99538 433 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP44Q9C0F1 390 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 DNPEPQ9ULA0 475 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 PLA2G4CQ9UP65 541 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 ERVW-1Q9UQF0 538 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 STK10O94804 968 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 STIP1P31948 543 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 OASLQ15646 514 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF19Q2TAC6 998 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 HTR3CQ8WXA8 447 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 ATG4AQ8WYN0 398 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 WBP1Q96G27 269 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 AP1M1Q9BXS5 423 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-214ENST00000592483 WASH3PC4AMC7 463 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 J3KR12 359 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 GLDCP23378 1020 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TPMTP51580 245 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 STARD3Q14849 445 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 RTP5Q14D33 572 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SH2D3CQ8N5H7 860 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TEX26Q8N6G2 289 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP112Q8N8E3 955 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 NETO2Q8NC67 525 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 GRK7Q8WTQ7 553 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 NRSN2Q9GZP1 204 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SEPT3Q9UH03 358 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SNX11Q9Y5W9 270 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPN13Q12923 2485 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP9BO43861 1147 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 PEX11BO96011 259 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CDK4P11802 303 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CCNB1P14635 433 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 LBRQ14739 615 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 MARC1Q5VT66 337 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA4Q8NEY3 305 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 ATL2Q8NHH9 583 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 FGF11Q92914 225 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 RTP4Q96DX8 246 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 MRGPRX3Q96LB0 322 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 FTSJ1Q9UET6 329 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TRHDEQ9UKU6 1024 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 NEBLO76041 1014 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 IGLV3-19P01714 112 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SRCP12931 536 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 VAV1P15498 845 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 RBL1P28749 1068 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 COILP38432 576 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TLE3Q04726 772 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF235Q14590 738 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 PLPP6Q8IY26 295 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP11CQ8NB49 1132 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 PSKH2Q96QS6 385 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 IL12RB2Q99665 862 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM118BQ9BPY3 351 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 PCED1AQ9H1Q7 454 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 L2HGDHQ9H9P8 463 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 STON1Q9Y6Q2 735 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNN4O15554 427 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TMCC1O94876 653 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 MMP13P45452 471 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CCT8P50990 548 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CXADRP78310 365 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 ENPP2Q13822 863 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 TEAD4Q15561 434 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 INAVAQ3KP66 663 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 LINGO4Q6UY18 593 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 SLCO2A1Q92959 643 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 USP29Q9HBJ7 922 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 PCYOX1Q9UHG3 505 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-214ENST00000592483 C5orf60A6NFR6 353 aa23.85■■□□□ 1.41
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