RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-209ENST00000589469 ITGAVP06756 1048 aa20.2■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 RABIFP47224 123 aa20.2■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 FAM193AP78312 1265 aa20.2■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 ITKQ08881 620 aa20.2■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 KIAA1328Q86T90 577 aa20.2■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.2■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 CDC6Q99741 560 aa20.2■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 26.9
PSME3-209ENST00000589469 AMACRQ9UHK6 382 aa20.2■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.2■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.2■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.2■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 CPP00450 1065 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 C6P13671 934 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 CCNB1P14635 433 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 LIG3P49916 1009 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 DYNLT1P63172 113 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 TFDP2Q14188 446 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 PDK1Q15118 436 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 SAP25Q8TEE9 199 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 SPOCK2Q92563 424 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 CENPTQ96BT3 561 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 SEMA3CQ99985 751 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.19■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 CFAP69A5D8W1 941 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 CES1P23141 567 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 NFKBIAP25963 317 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 PMLP29590 882 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 CDKN2BP42772 138 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 SEMG2Q02383 582 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 TRAF2Q12933 501 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 TAZQ16635 292 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 NPNTQ6UXI9 565 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 DPPA4Q7L190 304 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 LGMNQ99538 433 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 GPR27Q9NS67 375 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 COQ6Q9Y2Z9 468 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 CACNA1BQ00975 2339 aa20.18■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 PJA2O43164 708 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 HLA-DQB2P05538 268 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 ELFN1P0C7U0 828 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 IGFALSP35858 605 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 MARCKSL1P49006 195 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 GSDMDP57764 484 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 PFN3P60673 137 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 RALGDSQ12967 914 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 BNIP3Q12983 259 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 LRRC14Q15048 493 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 GLRX5Q86SX6 157 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 IFT43Q96FT9 208 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 OLFM3Q96PB7 478 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.17■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 KCNK1O00180 336 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 PGLSO95336 258 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 JCHAINP01591 159 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 KRT10P13645 584 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 NR2C2P49116 596 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 DSC2Q02487 901 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 AP1B1Q10567 949 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 FOXC1Q12948 553 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 AGERQ15109 404 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 IRF4Q15306 451 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 KAZNQ674X7 775 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 EXD1Q8NHP7 514 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 KRT35Q92764 455 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 DESI2Q9BSY9 194 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.16■□□□□ 0.82
PSME3-209ENST00000589469 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms