RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 EMBQ6PCB8 327 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 NFU1Q9UMS0 254 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF292O60281 2723 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 MEI4A8MW99 385 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 GFRA3O60609 400 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 GJB3O75712 270 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 DPP6P42658 865 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TAS2R38P59533 333 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 CREB5Q02930 508 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 IL12RB2Q99665 862 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 PREBQ9HCU5 417 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 SNX24Q9Y343 169 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 DOCK9Q9BZ29 2069 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TSPAN11A1L157 253 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 HACD1B0YJ81 288 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 C10orf142B7Z368 130 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 MTSS1O43312 755 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 KRT14P02533 472 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 HLA-DQB2P05538 268 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 BCL2L1Q07817 233 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 ZBTB17Q13105 803 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 XRCC4Q13426 336 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TRADDQ15628 312 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 CFAP58Q5T655 872 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 KIAA0895LQ68EN5 471 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 RAB7BQ96AH8 199 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 CFAP69A5D8W1 941 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 H7C0C1 242 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 SOCS5O75159 536 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 JCHAINP01591 159 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 ITPKAP23677 461 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 HOXD12P35452 270 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 MPLP40238 635 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 ATP5OP48047 213 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 CALCOCO2Q13137 446 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 SYT12Q8IV01 421 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 BIRC7Q96CA5 298 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 SEMA3CQ99985 751 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 NOD2Q9HC29 1040 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 AP1G1O43747 822 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 LRP3O75074 770 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 FSBPO95073 299 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 CES1P23141 567 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 ADCY8P40145 1251 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 CCR5P51681 352 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 ITKQ08881 620 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 NEK5Q6P3R8 708 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 BBOF1Q8ND07 529 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 PIGKQ92643 395 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 SNF8Q96H20 258 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4D-208ENST00000588667 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms