RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NDE1Q9NXR1 346 aa16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POMPQ9Y244 141 aa16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRCH1Q9Y2L9 728 aa16.57■□□□□ 0.24
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